Estudo de associação ampla do genoma para deposição de gordura e rendimento de carcaça em galinhas

• Processo: 14/21380-9
• Modalidade de apoio: Bolsas no Brasil - Doutorado
• Data de Início da vigência: 01 de maio de 2015
• Data de Término da vigência: 02 de março de 2018
• Área de conhecimento: Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
• Acordo de Cooperação: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
• Pesquisador responsável: Luiz Lehmann Coutinho
• Beneficiário: Gabriel Costa Monteiro Moreira
• Instituição Sede: Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALQ). Universidade de São Paulo (USP). Piracicaba , SP, Brasil
• Vinculado ao auxílio: 14/08704-0 - Identificação de locos de interesse zootécnico na galinha doméstica, AP.TEM
• Bolsa(s) vinculada(s): 16/00569-1 - Imputação e associação genômica ampla utilizando haplótipos para gordura abdominal em galinhas., BE.EP.DR
• Assunto(s): Genomas Carcaça
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Genes candidatos | Gwas | Qtl | Biotecnologia Animal (Biologia Molecular)

Resumo

A produção de carne de frango brasileira tem uma grande importância na economia mundial, o que é um resultado da constante melhoria de características de desempenho, principalmente devido ao melhoramento genético. Animais selecionados para crescimento rápido e maior deposição de músculo apresentam também, maior deposição de gordura na carcaça. O excesso de gordura depositada na carcaça é um fator negativo à produção considerando o custo e dificuldade de processamento bem como, a depreciação no valor do produto. A identificação dos componentes genéticos responsáveis por parte da variação observada (fenótipo) é fundamental aos programas de melhoramento genético permitindo assim, a seleção de animais que apresentam a característica fenotípica de interesse. A deposição de gordura é uma característica controlada por diversos genes que participam no metabolismo de lipídeos. Novas tecnologias como a de genotipagem em larga escala, a qual utiliza chip de SNPs tem permitido a associação genômica entre o genótipo e as características fenotípicas de interesse. O objetivo deste estudo é identificar regiões e genes candidatos associados a características relacionadas à deposição de gordura e rendimento de carcaça por meio da análise do estudo de associação ampla (GWAS). Para este fim, será realizada a genotipagem com chip de alta densidade de SNPs Chicken 600K Affymetrix®Axiom® de 2.000 animais (1.500 da população referência pura de corte TT e 500 da população experimental F2, ambas da EMBRAPA Suínos e Aves). Posteriormente, será realizado GWAS para 22 fenótipos envolvidos com deposição de gordura e rendimento de carcaça. Espera-se encontrar as regiões do genoma associadas a estas características. Os resultados permitirão identificar genes candidatos posicionais relacionados às características estudadas. (AU)

Publicações científicas

(8)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

COSTA ALMEIDA, OCTAVIO AUGUSTO; MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; REZENDE, FERNANDA MARCONDES; BOSCHIERO, CLARISSA; PEIXOTO, JANE DE OLIVEIRA; GUARATINI IBELLI, ADRIANA MERCIA; LEDUR, MONICA CORREA; DE NOVAIS, FRANCISCO JOSE; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Identification of selection signatures involved in performance traits in a paternal broiler line. BMC Genomics, v. 20, JUN 3 2019. (14/21380-9, 16/00569-1, 14/08704-0)

MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; POLETI, MIRELE DAIANA; PERTILLE, FABIO; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; GODOY, THAIS FERNANDA; LEDUR, MONICA CORREA; REECY, JAMES M.; GARRICK, DORIAN J.; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Unraveling genomic associations with feed efficiency and body weight traits in chickens through an integrative approach. BMC GENETICS, v. 20, n. 1, NOV 6 2019. (14/21380-9, 16/20440-3, 16/00569-1, 14/08704-0, 15/00616-7)

MOREIRA, GABRIEL COSTA MONTEIRO; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; REECY, JAMES M.; GODOY, THAIS FERNANDA; PERTILLE, FABIO; LEDUR, MONICA CORREA; MEIRA TAVARES MOURA, ANA SILVIA ALVES; GARRICK, DORIAN J.; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Integration of genome wide association studies and whole genome sequencing provides novel insights into fat deposition in chicken. SCIENTIFIC REPORTS, v. 8, NOV 1 2018. (15/00616-7, 14/08704-0, 14/21380-9, 16/20440-3, 16/00569-1)

BOSCHIERO, CLARISSA; MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; GHEYAS, ALMAS ARA; GODOY, THAIS FERNANDA; GASPARIN, GUSTAVO; SAMPAIO CORREA MARIANI, PILAR DRUMMOND; PADUAN, MARCELA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; LEDUR, MONICA CORREA; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. Genome-wide characterization of genetic variants and putative regions under selection in meat and egg-type chicken lines. BMC Genomics, v. 19, JAN 25 2018. (14/21380-9, 15/00616-7, 14/08704-0)

TREVISOLI, PRISCILA ANCHIETA; MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; PETRINI, JULIANA; ALVES MARGARIDO, GABRIEL RODRIGUES; LEDUR, MONICA CORREA; MOURAO, GERSON BARRETO; GARRICK, DORIAN; COUTINHO, LUIZ LEHMANN. A Missense Mutation in the MYBPH Gene Is Associated With Abdominal Fat Traits in Meat-Type Chickens. FRONTIERS IN GENETICS, v. 12, AUG 11 2021. (14/21380-9, 16/13589-0, 16/00569-1)

SALVIAN, MAYARA; MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; FREITAS SILVEIRA, ROBSON MATEUS; REIS, ANDREA PLOTZKI; D'AURIA, BRAYAN DIAS; PILONETTO, FABRICIO; GERVASIO, IZALLY CARVALHO; LEDUR, MONICA CORRE; COUTINHO, LUIZ LEHMANN; SPANGLER, MATTHEW LEE; et al. Estimation of breeding values using different densities of SNP to inform kinship in broiler chickens. LIVESTOCK SCIENCE, v. 267, p. 8-pg., 2022-11-29. (14/08704-0, 14/21380-9, 16/00569-1)

MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; REECY, JAMES M.; GODOY, THAIS FERNANDA; TREVISOLI, PRISCILA ANCHIETA; CANTAO, MAURICIO E.; LEDUR, MONICA CORREA; GUARATINI IBELLI, ADRIANA MERCIA; PEIXOTO, JANE DE OLIVEIRA; et al. A genome-wide association study reveals novel genomic regions and positional candidate genes for fat deposition in broiler chickens. BMC Genomics, v. 19, MAY 21 2018. (14/21380-9, 15/00616-7, 16/00569-1, 14/08704-0)

MONTEIRO MOREIRA, GABRIEL COSTA; SALVIAN, MAYARA; BOSCHIERO, CLARISSA; MELLO CESAR, ALINE SILVA; REECY, JAMES M.; GODOY, THAIS FERNANDA; LEDUR, MONICA CORREA; GARRICK, DORIAN; MOURAO, GERSON BARRETO; COUTINHO, LUIZ L.. Genome-wide association scan for QTL and their positional candidate genes associated with internal organ traits in chickens. BMC Genomics, v. 20, n. 1, AUG 22 2019. (14/21380-9, 16/00569-1, 14/08704-0)

Publicações acadêmicas

(Referências obtidas automaticamente das Instituições de Ensino e Pesquisa do Estado de São Paulo)

MOREIRA, Gabriel Costa Monteiro. Estudos de associação genômica ampla revelam regiões genômicas e genes candidatos posicionais para deposição de gordura em galinhas. 2018. Tese de Doutorado - Universidade de São Paulo (USP). Escola Superior de Agricultura Luiz de Queiroz (ESALA/BC) Piracicaba.