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Modelagem molecular das interações do complexo antígeno-anticorpo na investigação de doenças desmielinizantes autoimunes

Processo: 14/12082-4
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Vigência (Início): 01 de dezembro de 2014
Vigência (Término): 30 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Convênio/Acordo: Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Nível Superior (CAPES)
Pesquisador responsável:Fabio de Lima Leite
Beneficiário:
Instituição-sede : Centro de Ciências e Tecnologias para a Sustentabilidade (CCTS). Universidade Federal de São Carlos (UFSCAR). Sorocaba, SP, Brasil
Assunto(s):Esclerose múltipla   Encefalomielite autoimune experimental   Moléculas bioativas   Simulação por computador

Resumo

A esclerose múltipla (EM) é uma doença inflamatória desmielinizante autoimune que pode levar ao dano axonal. Os mecanismos moleculares envolvidos na manifestação da doença ainda continuam obscuros para a comunidade científica, apesar dos esforços com as pesquisas envolvendo a Encefalomielite Experimental Autoimune (EAE), que é modelo experimental da EM. O sistema imunológico é considerado fundamental no desenvolvimento da EM, tendo em vista as evidências na literatura da participação dos anticorpos autorreativos contra a glicoproteína de oligodendrócito da mielina e a proteína básica da mielina. Assim, com os avanços recentes da Modelagem Molecular Computacional (MMC), o presente projeto tem como objetivo central a aplicação dessa abordagem na descrição dos mecanismos moleculares de interações específicas do complexo antígeno-anticorpo relacionadas à EM e ao modelo experimental, a EAE. A metodologia envolve: (I) levantamento na literatura das informações relevantes sobre a doença e as proteínas de trabalho; (II) análise das estruturas tridimensionais disponíveis e otimização de modelos estruturais por Modelagem por Homologia; (III) aplicação do docking molecular para prever as orientações favoráveis das moléculas envolvidas; (IV) realização de simulações computacionais de dinâmica molecular do comportamento do sistema através de trajetórias de simulação; (V) aplicação de Mecânica Quântica (MQ) nas posições moleculares relevantes das trajetórias obtidas. A correlação entre os resultados teóricos e experimentais de microscopia de força atômica será realizada com simulações de dinâmica molecular direcionada, SMD, do inglês Steered Molecular Dynamics, e interpretada através da termodinâmica estatística. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre a bolsa:
Sensor nanométrico permite detectar herbicidas, além de marcadores de câncer e doença 

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
RODRIGUES, L. F.; IERICH, J. C. M.; ANDRADE, M. A.; HAUSEN, M. A.; LEITE, F. L.; MOREAU, ALBERTO L. D.; STEFFENS, CLARICE. Nanomechanical Cantilever-Based Sensor: An Efficient Tool to Measure the Binding Between the Herbicide Mesotrione and 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase. NANO, v. 12, n. 7 JUL 2017. Citações Web of Science: 0.
IERICH, JESSICA C. M.; OLIVEIRA, GUEDMILLER S.; VIG, ANA C. A.; AMARANTE, ADRIANO M.; FRANCA, EDUARDO F.; LEITE, FABIO L.; MASCARENHAS, YVONNE P. A Computational Protein Structure Refinement of the Yeast Acetohydroxyacid Synthase. Journal of the Brazilian Chemical Society, v. 26, n. 8, p. 1702-1709, AUG 2015. Citações Web of Science: 0.
GARCIA, PAMELA SOTO; DARIO MOREAU, ALBERTO LUIS; MAGALHAES IERICH, JESSICA CRISTIANE; ARAUJO VIG, ANA CAROLINA; HIGA, AKEMI MARTINS; OLIVEIRA, GUEDMILLER S.; ABDALLA, FABIO CAMARGO; HAUSEN, MOEMA; LEITE, FABIO L. A Nanobiosensor Based on 4-Hydroxyphenylpyruvate Dioxygenase Enzyme for Mesotrione Detection. IEEE SENSORS JOURNAL, v. 15, n. 4, p. 2106-2113, APR 2015. Citações Web of Science: 4.

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