Resumo
A cana-de-açúcar é uma das fontes mais importantes para a produção de biocombustíveis no Brasil. Também ocupa posição de destaque no agronegócio do estado de São Paulo. A produção de biocombustíveis a partir de cana-de-açúcar é dependente de sacarose como matéria prima. Espera-se que a indústria sucroalcooleira brasileira ganhe em competitividade desde que haja um aumento de produtividade (biomassa) garantindo a preservação do meio ambiente evitando-se o uso de novas terras. Aumento de produção de biomassa pode ser atingido através do uso de técnicas que permitam o monitoramento e modulação do metabolismo de sacarose em condições adequadas e restritivas de crescimento da planta, como por exemplo, condições de pouca disponibilidade de água. O uso potencial do bagaço como fonte de biomassa é dependente da disponibilização do carbono fixado nos polímeros que constituem a parede celular. O presente projeto tem como objetivo gerar um sequenciamento parcial de duas cultivares de cana de açúcar (R570 e SP80-3280) de modo a subsidiar o desenvolvimento de ferramentas moleculares que poderão auxiliar na compreensão deste genoma híbrido e poliplóide. A descoberta de genes e a identificação das regiões regulatórias envolvidas no metabolismo de sacarose e partição dos esqueletos de carbono na planta são algumas das áreas na pesquisa básica que serão beneficiadas pelo presente estudo. Programas de melhoramento também poderão ser beneficiados tendo a cesso a informações moleculares com potencial ao desenvolvimento de marcadores moleculares. Os cultivares modernos de cana-de-açúcar são híbridos de Saccharum officinarum e Saccharum spontaneum. Seu genoma monoplóide é estimado em aproximadamente 1GB comparável em escala aos genomas do milho e do ser humano. Utilizar-se-á uma abordagem combinada de sequencias gerada por pirosequenciamento e pelo método clássico de Sanger de 1000 clones de BAC. Uma coleção de ESTs geradas pelo projeto SUCEST, perfis de expressão em larga escala do projeto SUCEST-FUN e uma biblioteca de BACs da cultivar R570 estão disponíveis. O programa BIOEN irá gerar uma biblioteca de BACs da cultivar SP80-3280 que será triada para identificação de locos homólogos da cultivar R570. Deste modo será avaliada a questão de variação alélica não apenas nas regiões codificantes como também nas regulatórias. O mapeamento dos elementos de transposição nos BACs, análise do perfil de expressão nos arrays de populações contrastantes e polimorfismo de inserção contribuirão para verificar a associação destes elementos com a variabilidade de cana. Este estudo se insere em contexto mais amplo de uma comunidade científica que pretende desenvolver ferramentas de melhoramento genético com uma abordagem de biologia de sistemas para a compreensão da biologia de cana-de-açúcar. (AU)
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