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João Carlos Setubal

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Química (IQ)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Brasil

Professor Titular do Departamento de Bioquímica do Instituto de Química da Universidade de São Paulo e Professor Colaborador do Biocomplexity Institute (EUA). É PhD em Ciência da Computação pela University of Washington (1992). Possui graduação em Engenharia Mecânica pela Universidade de São Paulo (1979) e mestrado em Ciência da Computação pela Universidade Estadual de Campinas (1987). Foi professor do Instituto de Computação da Unicamp de 1986 a 2005 e professor/pesquisador do Virginia Bioinformatics Institute e do departamento de Computer Science da Virginia Tech (EUA) de 2004 a 2011. Atua na área de bioinformática. É coordenador do Programa Interunidades de Pós-Graduação em Bioinformática da USP. Mais informações em http://www.iq.usp.br/setubal. (Fonte: Currículo Lattes)

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(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações9
Citações10
Cit./Artigo1,1
Dados do Web of Science

WOOD‚ D.W.; SETUBAL‚ J.C.; KAUL‚ R.; MONKS‚ D.E.; KITAJIMA‚ J.P.; OKURA‚ V.K.; ZHOU‚ Y.; CHEN‚ L.; WOOD‚ G.E.; ALMEIDA JR‚ N.F.; et al. The genome of the natural genetic engineer Agrobacterium tumefaciens C58. Science, v. 294, n. 5550, p. 2317-2323, . (99/11876-5)

PYLRO, VICTOR S.; MORAIS, DANIEL K.; DE OLIVEIRA, FRANCISLON S.; DOS SANTOS, FAUSTO G.; LEMOS, LEANDRO N.; OLIVEIRA, GUILHERME; ROESCH, LUIZ F. W.. BMPOS: a Flexible and User-Friendly Tool Sets for Microbiome Studies. MICROBIAL ECOLOGY, v. 72, n. 2, p. 443-447, . Citações Web of Science: 4. (13/05325-5)

ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL; MARTINS, LAYLA FARAGE; PEREIRA, ROBERTA VERCIANO; THOMAS, ANDREW MALTEZ; BARBOSA, DEIBS; LEMOS, LEANDRO NASCIMENTO; MACHADO SILVA, GIANLUCA MAJOR; SILVA MOURA, LIVIA MARIA; CONDOMITTI EPAMINO, GEORGE WILLIAN; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO; et al. Microbial community structure and dynamics in thermophilic composting viewed through metagenomics and metatranscriptomics. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 4. (11/50870-6)

THOMAS, ANDREW M.; JESUS, ELIANE C.; LOPES, ADEMAR; AGUIAR, JR., SAMUEL; BEGNAMI, MARIA D.; ROCHA, RAFAEL M.; CARPINETTI, PAOLA AVELAR; CAMARGO, ANAMARIA A.; HOFFMANN, CHRISTIAN; FREITAS, HELANO C.; et al. Tissue-Associated Bacterial Alterations in Rectal Carcinoma Patients Revealed by 16S rRNA Community Profiling. FRONTIERS IN CELLULAR AND INFECTION MICROBIOLOGY, v. 6, . Citações Web of Science: 1. (15/01507-7, 13/07914-8)

AMGARTEN, DEYVID; MARTINS, LAYLA FARAGE; LOMBARDI, KAREN CRISTINA; ANTUNES, LUCIANA PRINCIPAL; SILVA DE SOUZA, ANA PAULA; NICASTRO, GIANLUCCA GONCALVES; KITAJIMA, ELLIOTT WATANABE; QUAGGIO, RONALDO BENTO; UPTON, CHRIS; SETUBAL, JOAO CARLOS; et al. Three novel Pseudomonas phages isolated from composting provide insights into the evolution and diversity of tailed phages. BMC Genomics, v. 18, . Citações Web of Science: 0. (15/14334-3, 11/50870-6, 14/16450-8)

PUIGVERT, MARINA; GUARISCHI-SOUSA, RODRIGO; ZULUAGA, PAOLA; COLL, NURIA S.; MACHO, ALBERTO P.; SETUBAL, JOAO C.; VALLS, MARC. Transcriptomes of Ralstonia solanacearum during Root Colonization of Solanum commersonii. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Citações Web of Science: 0. (12/15197-1)

ERILL, IVAN; PUIGVERT, MARINA; LEGRAND, LUDOVIC; GUARISCHI-SOUSA, RODRIGO; VANDECASTEELE, CELINE; SETUBAL, JOAO C.; GENIN, STEPHANE; GUIDOT, ALICE; VALLS, MARC. Comparative Analysis of Ralstonia solanacearum Methylomes. FRONTIERS IN PLANT SCIENCE, v. 8, . Citações Web of Science: 0. (12/15197-1)

LEMOS, LEANDRO N.; PEREIRA, ROBERTA V.; QUAGGIO, RONALDO B.; MARTINS, LAYLA F.; MOURA, LIVIA M. S.; DA SILVA, AMANDA R.; ANTUNES, LUCIANA P.; DA SILVA, ALINE M.; SETUBAL, JOAO C.. Genome-Centric Analysis of a Thermophilic and Cellulolytic Bacterial Consortium Derived from Composting. FRONTIERS IN MICROBIOLOGY, v. 8, . Citações Web of Science: 0. (13/05325-5)

KINKER, GABRIELA SARTI; THOMAS, ANDREW MALTEZ; CARVALHO, VINICIUS JARDIM; LIMA, FELIPE PRATA; FUJITA, ANDRE. Deletion and low expression of NFKBIA are associated with poor prognosis in lower-grade glioma patients. SCIENTIFIC REPORTS, v. 6, . Citações Web of Science: 0. (15/01507-7, 14/27287-0, 13/03447-6, 15/01587-0, 14/09576-5)

LIMA-JUNIOR, JAMES DALTRO; VIANA-NIERO, CRISTINA; CONDE OLIVEIRA, DANIEL V.; MACHADO, GABRIEL ESQUITINI; DA SILVA RABELLO, MICHELLE CRISTIANE; MARTINS-JUNIOR, JOAQUIM; MARTINS, LAYLA FARAGE; DIGIAMPIETRI, LUCIANO ANTONIO; DA SILVA, ALINE MARIA; SETUBAL, JOAO CARLOS; et al. Characterization of mycobacteria and mycobacteriophages isolated from compost at the Sao Paulo Zoo Park Foundation in Brazil and creation of the new mycobacteriophage Cluster U. BMC Microbiology, v. 16, . Citações Web of Science: 1. (11/18326-4, 14/01825-6, 11/50870-6, 12/04911-5)

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