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Igor Polikarpov

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Universidade de São Paulo (USP). Instituto de Física de São Carlos (IFSC)  (Instituição-sede da última proposta de pesquisa)
País de origem: Rússia

Igor Polikarpov é Professor Titular do Instituto de Física de São Carlos e coordenador do polo Temático de Energias Renováveis e Ambiente (poloTErRA/USP-São Carlos). Seus principais interesses de pesquisa estão centrados em Biologia Estrutural e Biofísica Molecular e suas aplicações em Bioenergia e Biotecnologia. Igor Polikarpov possui graduação em Física pela Universidade da Bielorussia (1983), doutorado em Ciências Físico-Matemáticas pela Universidade da Bielorussia (1989), pós-doutorado pela Academia de Ciências da Letônia (1991), pós-doutorado pela Max Planck Gesselschaft (1993) e pós-doutorado pela Edinburgh University (1995) . Tem 220+ artigos publicados em revistas internacionais, os quais foram citados mais de 4.300 vezes em outros artigos científicos (ISI). Coordenou projetos de colaboração entre Brasil - União Europeia (FP7) e Brasil - UK (FAPESP-RCUK) e está coordenando projetos de colaboração com Índia e Argentina. Também tem liderado projetos de colaboração com empresas biotecnológicas e farmacêuticas nacionais e construção de instalações cientificas de grande porte (linhas de luz de cristalografia de proteínas MX-1 e MX-2 no Laboratório Nacional de Luz Síncrotron/LNLS). É Professor Honorário da Universidade do Bath (UK) e Professor Visitante Honorário do Departamento de Biologia da Universidade de York (UK). É membro do Editorial Board das revistas Biotechnology Letters (Springer) e Enzyme Engineering (OMICS International). Foi um dos proponentes do Programa Integrado de Doutorado em Bioenergia (USP, UNESP e UNICAMP). Igor Polikarpov é Comendador da Ordem Nacional do Mérito Científico e membro titular da Academia de Ciências do Estado de São Paulo. (Fonte: Currículo Lattes)

Auxílios à pesquisa
Bolsas no país
Bolsas no exterior

Apoio FAPESP em números*

*Quantidades atualizadas em 15/07/2017

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Palavras-chave utilizadas pelo pesquisador

AIDS Aldosterona Bacillus licheniformis Bactérias gram-negativas Bagaço de cana-de-açúcar Biocombustíveis de segunda geração Biocombustíveis Bioenergia Bioetanol Biofísica Molecular Biofísica de Processos e Sistemas Biofísica Biologia Molecular Biologia celular Biologia computacional Biologia estrutural Biologia molecular Biomassa Biomassa Biopolímeros Bioquímica Biotecnologia Cana-de-açúcar Capsaicina Celulase Celulose de madeira Celulose Ciência da Computação Ciências Biológicas Ciências Exatas e da Terra Cooperação internacional Copaifera langsdorffii Cristalização Cristalografia de proteínas Cristalografia de proteínas Cristalografia de raios X Cristalografia Degradação de biomassa Descoberta de drogas Despolimerização Difração por raios X Domínios PDZ Engenharia Química Engenharia ambiental Engenharia de proteínas Engenharias Enzimas celulolíticas Enzimas hidrolíticas Enzimas lignocelulolíticas Enzimas Enzimologia Espalhamento de raios X a baixos ângulos Espectrometria de massas Estrógenos Estrutura de proteínas Estrutura molecular Etanol Expressão de proteínas Fatores de transcrição Fermentação industrial Fermentação Física da Matéria Condensada Física Flavonoides Fontes alternativas de energia Fungos mitospóricos Fungos termófilos Genética Molecular e de Microorganismos Genética Glicoproteínas Glicosídeo hidrolases Gloeophyllum trabeum Glutationa sintase HIV-2 HIV Hidrolases Hidrólise enzimática Hidrólise Hormônios tireóideos Impactos ambientais Inibidores enzimáticos Intercâmbio de pesquisadores Isoformas de proteínas Lactoglobulinas Ligantes Lignocelulose Macromolécula Materiais avançados Materiais lignocelulósicos Materiais nanoestruturados Metagenoma Metagenômica Metodologia e Técnicas da Computação Microbiologia Microscopia confocal Microscopia de força atômica Microscopia eletrônica Monômeros N-glicosil hidrolases Operações Industriais e Equipamentos para Engenharia Química PPAR alfa PPAR gama Parede celular vegetal Parede celular Pentoses Peptídeo hidrolases Prebióticos Produção industrial Produtos naturais Proteínas da membrana Proteínas de membrana transportadoras Proteínas recombinantes Proteômica Purificação de proteínas Química de Macromoléculas Radiação síncrotron Raios X Receptor X do pregnano Receptores androgênicos Receptores ativados por proliferador de peroxissomo Receptores citoplasmáticos e nucleares Receptores de mineralocorticoides Receptores do ácido retinoico Receptores dos hormônios tireóideos Receptores hormonais Receptores nucleares órfãos Regulação alostérica Relação estrutura-atividade Saccharomyces cerevisiae Simulação de dinâmica molecular Síntese enzimática Síntese química Terapia fotodinâmica Transcrição gênica Transcriptoma Transcriptômica Transfecção Trichoderma harzianum Trichoderma reesei Trichoderma Xilose beta-Galactosidase beta-Manosidase

Publicações resultantes de Auxílios e Bolsas sob responsabilidade do(a) pesquisador(a) (71)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

Publicações65
Citações698
Cit./Artigo10,7
Dados do Web of Science

FIGUEIRA, A. C. M.; SAIDEMBERG, D. M.; SOUZA, P. C. T.; MARTINEZ, L.; SCANLAN, T. S.; BAXTER, J. D.; SKAF, M. S.; PALMA, M. S.; WEBB, P.; POLIKARPOV, I.. Analysis of Agonist and Antagonist Effects on Thyroid Hormone Receptor Conformation by Hydrogen/Deuterium Exchange. MOLECULAR ENDOCRINOLOGY, v. 25, n. 1, p. 15-31, . Citações Web of Science: 23. (03/09462-5, 08/00078-1, 06/00182-8)

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DE MOURA, PATRICIA RIBEIRO; WATANABE, LEANDRA; BLEICHER, LUCAS; COLAU, DIDIER; DUMOUTIER, LAURE; LEMAIRE, MURIEL M.; RENAULD, JEAN-CHRISTOPHE; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of a soluble decoy receptor IL-22BP bound to interleukin-22. FEBS Letters, v. 583, n. 7, p. 1072-1077, . Citações Web of Science: 26. (06/00182-8, 06/01534-5)

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GOLUBEV, ALEXANDER M.; ROJAS, ADRIANA L.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; BLEICHER, LUCAS; KULMINSKAYA, ANNA A.; ENEYSKAYA, ELENA V.; POLIKARPOV, IGOR. Crystallization and Preliminary Crystallographic Analysis of Laminarinase from Rhodothermus marinus: A Case of Pseudomerohedral Twinning. PROTEIN AND PEPTIDE LETTERS, v. 15, n. 10, p. 1142-1144, . Citações Web of Science: 1. (04/08070-9, 06/00182-8)

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BLEICHER, LUCAS; DE MOURA, PATRICIA RIBEIRO; WATANABE, LEANDRA; COLAU, DIDIER; DUMOUTIER, LAURE; RENAULD, JEAN-CHRISTOPHE; POLIKARPOV, IGOR. Crystal structure of the IL-22/IL-22R1 complex and its implications for the IL-22 signaling mechanism. FEBS Letters, v. 582, n. 20, p. 2985-2992, . Citações Web of Science: 47. (06/00182-8, 06/60860-0, 06/01534-5)

CUNHA LIMA, SUZANA T.; NGUYEN, NGOC-HA; TOGASHI, MARIE; APRILETTI, JAMES W.; NGUYEN, PHUONG; POLIKARPOV, IGOR; SCANLAN, THOMAS S.; BAXTER, JOHN D.; WEBB, PAUL. Differential effects of TR ligands on hormone dissociation rates: Evidence for multiple ligand entry/exit pathways. JOURNAL OF STEROID BIOCHEMISTRY AND MOLECULAR BIOLOGY, v. 117, n. 4-5, p. 125-131, . Citações Web of Science: 3. (06/00182-8)

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MIGLIORINI FIGUEIRA, ANA CAROLINA; LIMA, LUIS MAURICIO T. R.; LIMA, LEONARDO H. F.; RANZANI, AMERICO T.; MULE, GUILHERME DOS SANTOS; POLIKARPOV, IGOR. Recognition by the Thyroid Hormone Receptor of Canonical DNA Response Elements. BIOCHEMISTRY, v. 49, n. 5, p. 893-904, . Citações Web of Science: 6. (06/00182-8, 08/00078-1, 07/01441-0, 03/09462-5)

LIMA, MARISA A.; OLIVEIRA-NETO, MARIO; KADOWAKI, MARCO ANTONIO S.; ROSSETO, FLAVIO R.; PRATES, ERICA T.; SQUINA, FABIO M.; LEME, ADRIANA F. P.; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Aspergillus niger beta-Glucosidase Has a Cellulase-like Tadpole Molecular Shape INSIGHTS INTO GLYCOSIDE HYDROLASE FAMILY 3 (GH3) beta-GLUCOSIDASE STRUCTURE AND FUNCTION. Journal of Biological Chemistry, v. 288, n. 46, p. 32991-33005, . Citações Web of Science: 14. (08/56255-9, 09/54035-4, 10/16542-9)

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PRATES, ERICA T.; STANKOVIC, IVANA; SILVEIRA, RODRIGO L.; LIBERATO, MARCELO V.; HENRIQUE-SILVA, FLAVIO; PEREIRA, JR., NEI; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. X-ray Structure and Molecular Dynamics Simulations of Endoglucanase 3 from Trichoderma harzianum: Structural Organization and Substrate Recognition by Endoglucanases That Lack Cellulose Binding Module. PLoS One, v. 8, n. 3, . Citações Web of Science: 14. (08/56255-9, 10/08680-2, 09/54035-4)

LIMA, MARISA A.; LAVORENTE, GABRIELA B.; DA SILVA, HANA K. P.; BRAGATTO, JULIANO; REZENDE, CAMILA A.; BERNARDINELLI, OIGRES D.; DEAZEVEDO, EDUARDO R.; GOMEZ, LEONARDO D.; MCQUEEN-MASON, SIMON J.; LABATE, CARLOS A.; et al. Effects of pretreatment on morphology, chemical composition and enzymatic digestibility of eucalyptus bark: a potentially valuable source of fermentable sugars for biofuel production - part 1. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 6, . Citações Web of Science: 33. (09/18354-8, 10/52362-5, 08/56255-9, 10/08370-3, 10/11135-6)

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MARTINEZ, LEANDRO; SOUZA, PAULO C. T.; GARCIA, WANIUS; BATISTA, FERNANDA A. H.; PORTUGAL, RODRIGO V.; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; NAKAHIRA, MARCEL; LIMA, LUIS M. T. R.; POLIKARPOV, IGOR; SKAF, MUNIR S.. On the Denaturation Mechanisms of the Ligand Binding Domain of Thyroid Hormone Receptors. Journal of Physical Chemistry B, v. 114, n. 3, p. 1529-1540, . Citações Web of Science: 5. (06/06831-8, 06/00182-8)

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COLUSSI, FRANCIELI; GARCIA, WANIUS; ROSSETO, FLAVIO RODOLFO; SOARES DE MELLO, BRUNO LUAN; DE OLIVEIRA NETO, MARIO; POLIKARPOV, IGOR. Effect of pH and temperature on the global compactness, structure, and activity of cellobiohydrolase Cel7A from Trichoderma harzianum. EUROPEAN BIOPHYSICS JOURNAL WITH BIOPHYSICS LETTERS, v. 41, n. 1, p. 89-98, . Citações Web of Science: 9. (10/08370-3, 09/54035-4, 10/16542-9)

TEXTOR, LARISSA C.; SANTOS, JADEMILSON C.; HIDALGO CUADRADO, NAZARET; ROIG, MANUEL G.; ZHADAN, GALINA G.; SHNYROV, VALERY L.; POLIKARPOV, IGOR. Purification, crystallization and preliminary crystallographic analysis of peroxidase from the palm tree Chamaerops excelsa. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 67, n. 12, p. 1641-1644, . Citações Web of Science: 1. (09/52840-7, 09/14333-6)

PUHL, ANA C.; BERNARDES, AMANDA; SILVEIRA, RODRIGO L.; YUAN, JING; CAMPOS, JESSICA L. O.; SAIDEMBERG, DANIEL M.; PALMA, MARIO S.; CVORO, ALEKSANDRA; AYERS, STEPHEN D.; WEBB, PAUL; et al. Mode of Peroxisome Proliferator-Activated Receptor gamma Activation by Luteolin. MOLECULAR PHARMACOLOGY, v. 81, n. 6, p. 788-799, . Citações Web of Science: 37. (07/58443-4, 10/08680-2)

BATISTA, FERNANDA A. H.; TRIVELLA, DANIELA B. B.; BERNARDES, AMANDA; GRATIERI, JOYCE; OLIVEIRA, PAULO S. L.; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; WEBB, PAUL; POLIKARPOV, IGOR. Structural Insights into Human Peroxisome Proliferator Activated Receptor Delta (PPAR-Delta) Selective Ligand Binding. PLoS One, v. 7, n. 5, . Citações Web of Science: 15. (06/00182-8, 09/53853-5, 10/17048-8)

LIBERATO, MARCELO VIZONA; GENEROSO, WESLEY CARDOSO; MALAGO, JR., WILSON; HENRIQUE-SILVA, FLAVIO; POLIKARPOV, IGOR. Crystallization and preliminary X-ray diffraction analysis of endoglucanase III from Trichoderma harzianum. ACTA CRYSTALLOGRAPHICA SECTION F-STRUCTURAL BIOLOGY COMMUNICATIONS, v. 68, n. 3, p. 306-309, . Citações Web of Science: 3. (09/52840-7, 09/14333-6)

BERNARDES, AMANDA; BATISTA, FERNANDA A. H.; NETO, MARIO DE OLIVEIRA; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; WEBB, PAUL; SAIDEMBERG, DANIEL; PALMA, MARIO S.; POLIKARPOV, IGOR. Low-Resolution Molecular Models Reveal the Oligomeric State of the PPAR and the Conformational Organization of Its Domains in Solution. PLoS One, v. 7, n. 2, . Citações Web of Science: 10. (07/58443-4, 06/00182-8, 08/00078-1, 08/05637-9, 10/17048-8)

REZENDE, CAMILA ALVES; DE LIMA, MARISA APARECIDA; MAZIERO, PRISCILA; DEAZEVEDO, EDUARDO RIBEIRO; GARCIA, WANIUS; POLIKARPOV, IGOR. Chemical and morphological characterization of sugarcane bagasse submitted to a delignification process for enhanced enzymatic digestibility. BIOTECHNOLOGY FOR BIOFUELS, v. 4, p. 1-18, . Citações Web of Science: 96. (09/18354-8, 10/11135-6, 10/08370-3)

MARTINEZ, LEANDRO; NASCIMENTO, ALESSANDRO S.; NUNES, FABIO M.; PHILLIPS, KEVIN; APARICIO, RICARDO; DIAS, SANDRA MARTHA G.; FIGUEIRA, ANA CAROLINA M.; LIN, JEAN H.; NGUYEN, PHUONG; APRILETTI, JAMES W.; et al. Gaining ligand selectivity in thyroid hormone receptors via entropy. PROCEEDINGS OF THE NATIONAL ACADEMY OF SCIENCES OF THE UNITED STATES OF AMERICA, v. 106, n. 49, p. 20717-20722, . Citações Web of Science: 41. (06/00182-8)

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TEXTOR, LARISSA C.; COLUSSI, FRANCIELI; SILVEIRA, RODRIGO L.; SERPA, VIVIANE; DE MELLO, BRUNO L.; MUNIZ, JOAO RENATO C.; SQUINA, FABIO M.; PEREIRA, JR., NEI; SKAF, MUNIR S.; POLIKARPOV, IGOR. Joint X-ray crystallographic and molecular dynamics study of cellobiohydrolase I from Trichoderma harzianum: deciphering the structural features of cellobiohydrolase catalytic activity. FEBS Journal, v. 280, n. 1, p. 56-69, . Citações Web of Science: 20. (10/08680-2, 09/54035-4)

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Patente(s) depositada(s)

OLIGONUCLEOTÍDEOS PARA PRODUÇÃO DE ENDOGLUCANASE, SEQUÊNCIAS PARA PRODUÇÃO DE ENDOGLUCANASE, PROCESSO DE OBTENÇÃO DE ENDOGLUCANASE E USOS DA ENDOGLUCANASE BR1020130108090 - Universidade de São Paulo (USP). Igor Polikarpov; Vanessa de Oliveira Arnoldi Pellegrini; Viviane Isabel Serpa - 02 de maio de 2013

SISTEMA DE INJEÇÃO DE GASES PARA RETORES DE AGITAÇÃO PNEUMÁTICA BR1020140186379 - Universidade de São Paulo (USP). Igor Polikarpov; Patrícia Aparecida Santiago Monteiro; Paulo Seleghim Júnior - 29 de julho de 2014

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