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VII simpósio de microbiologia aplicada

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Fernando Carlos Pagnocca
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Organização de Reunião Científica
Processo:15/01277-1
Vigência: 27 de maio de 2015 - 29 de maio de 2015
Assunto(s):Microbiologia industrialSistemáticaMicrobiologia ambiental

Determinação de agrupamentos de genes sintetizadores de fenazinas antibióticas e montagem das vias biossintéticas correlacionadas, em uma nova espécie de Streptomyces (CCMA/Caat52) isolado da caatinga do Brasil

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Embrapa Meio-Ambiente. Empresa Brasileira de Pesquisa Agropecuária (EMBRAPA). Ministério da Agricultura, Pecuária e Abastecimento (Brasil). Jaguariúna, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Itamar Soares de Melo
Supervisor no exterior: Paul Frederick Long
Local de pesquisa: King's College London (Reino Unido)
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Processo:14/24556-0
Vigência: 01 de maio de 2015 - 30 de abril de 2016
Assunto(s):CaatingaStreptomycesClusters
Resumo
Os Complexo Policetídios (PKS) são produtos naturais microbianos (incluindo medicamentos clinicamente úteis), cujas estruturas químicas se correlacionam com a sequência das enzimas responsáveis pela modulação de suas respectivas biossínteses. Uma vez que a estrutura do gene pode ser inferida a partir da estrutura química da molécula, uma forma inversa de determinação do perfil metabólico microbiano. Atualmente, com o sequenciamento do genoma em ampla escala de actinomicetos, tem revelado um diversidade química inexplorado nos Streptomyces cultiváveis, uma vez que foram detectados clusters de vias biosintéticas até então enigmáticas (silenciosos, mas com funções desconhecidas). Então, a expressão de genes correlacionados à biossíntese é uma via que se abre para o desenvolvimento da biologia sintética de produtos naturais, em que PKS são projetados a sintetizar uma molécula alvo quando requerida, neste caso proveniente do metabolismo secundário. De acordo com estudos preliminares da análise do sequenciamento do genoma da linhagem modelo neste estudo, o isolado CCMA/Caat52 é uma nova espécie de Streptomyces e produtora de compostos naturais pertencente ao grupo de fenazinas com presença de apenas um grupo de PKSII conhecido para este composto. Muito pouco se sabe sobre os genes correlacionados a sínteses deste compostos em Actonobacteria, este projeto tem como escopo a determinação de genes (PKS e NRPS) responsável pela vias biosinteticas construtoras de fenazinas e identificação das enzimas que catalizam a produção metabólica envolvida. Os dados gerados será de fundamental importância na consolidação desta linha de pesquisa em bioprospecção microbiana utilizando como ferramentas a descoberta e indicação de genes relacionados à biossíntese de metabólitos secundários e sequenciamento de todo o genoma de Streptomyces sp no Laboratório de Microbiologia Ambiental da Embrapa Meio Ambiente. (AU)

Pesquisa de genes codificadores de beta-lactamases em isolados bacterianos de solo com resistência aos beta-lactâmicos

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Eliana Guedes Stehling
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Processo:14/26367-0
Vigência: 01 de fevereiro de 2015 - 31 de dezembro de 2015
Assunto(s):Beta-lactamasesMicrobiologia ambiental
Resumo
O solo possui uma grande diversidade microbiana e as principais espécies encontradas pertencem aos gêneros Bacillus, Clostridium, Arthrobacter, Pseudomonas, Rhizobium, Azotobacter e Nitrobacter. Entre essas espécies de bactérias, destaca-se a Pseudomonas, um patógeno oportunista responsável por infecções de grande relevância clínica, e outras espécies pertencentes aos gêneros Burkholderia, Acinetobacter e Stenotrophomonas. Essas bactérias estão se tornando cada vez mais resistentes aos antibióticos, sendo possível encontrar bactérias na natureza que são resistentes à terapia antimicrobiana, ou seja, a antibióticos que são utilizados na clínica médica na atualidade. Um dos mecanismos de resistência adquirida aos beta-lactâmicos é a produção de beta-lactamases. O presente projeto de pesquisa tem como objetivo avaliar se o perfil de resistência a alguns antimicrobianos beta-lactâmicos em isolados bacterianos de solo é devido à produção de beta-lactamases de espectro estendido. (AU)

Prospecção de metabólitos secundários a partir da microbiota de ambiente psicrofílico

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Coordenadoria de Centros e Núcleos Disciplinares (COCEN). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Valéria Maia de Oliveira
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo:14/17936-1
Vigência: 01 de janeiro de 2015 - 31 de julho de 2017
Assunto(s):Anti-infecciososMetabólitos secundáriosMetagenômicaMicrobiologia ambiental
Resumo
O continente Antártico é considerado uma região com condições climáticas extremas, com baixas temperaturas, alta incidência de radiação UV e déficit hídrico. Possui um bioma muito singular, o que significa que grande parte do seu patrimônio biológico não pode ser encontrado em outro lugar do planeta. Nestas condições espera-se encontrar micro-organismos adaptados (extremófilos) que possam ser explorados para a identificação de arsenais metabólicos únicos e versáteis com possíveis aplicações biotecnológicas em diversas áreas. O desenvolvimento de pesquisas recentes em nosso laboratório com procariotos e fungos na Antártica permitiu o isolamento de um grande número de micro-organismos (em torno de 1200) daquela região, muitos deles possivelmente indígenas, ainda não catalogados e não estudados quanto à produção de produtos bioativos potenciais. Além disso, como aproximadamente 99% das bactérias do ambiente não podem ser isolados por métodos convencionais de cultivo, tecnologias moleculares que utilizam da análise do material genético do ambiente, como a "metagenômica", são necessárias para fornecer informações mais precisas sobre a diversidade e potencial biotecnológico da comunidade microbiana. Dessa forma, integrantes do nosso grupo de pesquisa, construiram recentemente uma biblioteca metagenômica a partir de DNA de alto peso obtido de biofilme formado sobre o solo da Antártica. Essa biblioteca conta com mais de 80.000 clones já preservados por ultra-congelamento.Com base nesse repertório de micro-organismos isolados, somado a uma biblioteca metagenômica, este estudo visa buscar e descobrir produtos naturais de interesse biotecnológico a partir desses recursos microbianos, com foco em metabolitos secundários de aplicação na indústria farmacêutica ou cosmética (AU)

VI simpósio de microbiologia - IBILCE/UNESP

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Instituto de Biociências, Letras e Ciências Exatas (IBILCE). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de São José do Rio Preto. São José do Rio Preto, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Luis Henrique Zanini Branco
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Organização de Reunião Científica
Processo:14/09204-0
Vigência: 11 de agosto de 2014 - 14 de agosto de 2014
Assunto(s):Microbiologia de alimentosMicrobiologia industrialVirologiaMicrobiologia ambiental

Pesquisa de genes de virulência e caracterização do perfil de resistência a antimicrobianos e metais pesados em isolados ambientais de Pseudomonas aeruginosa

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Faculdade de Ciências Farmacêuticas de Ribeirão Preto (FCFRP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Pesquisador responsável:André Pitondo da Silva
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Biologia e Fisiologia dos Microorganismos
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Processo:14/08530-1
Vigência: 01 de junho de 2014 - 31 de maio de 2015
Assunto(s):Anti-infecciososMetais pesadosPseudomonas aeruginosaResistênciaSolosMicrobiologia ambiental
Resumo
Pseudomonas aeruginosa é um patógeno oportunista que pode possuir numerosos fatores de virulência que lhe confere a capacidade de causar infecções graves, agudas e crônicas. Devido à sua versatilidade metabólica e adaptabilidade em uma grande diversidade de ambientes, espécies de P. aeruginosa têm se adaptado bem às pressões seletivas do ambiente. Nesse sentido, há trabalhos na literatura que demonstram o desenvolvimento de resistência a metais pesados em solos contaminados com esses poluentes. Alguns estudos, inclusive, indicam que o desenvolvimento da resistência a metais pesados tem uma séria implicação, uma vez que isso pode contribuir para o surgimento concomitante de resistência a antimicrobianos. Desse modo, a ocorrência concomitante da resistência a metais pesados e a antimicrobianos, associada à presença de genes de virulência, representa uma potencial ameaça à saúde humana e ao equilíbrio ambiental. Assim, o presente projeto de pesquisa tem como objetivo isolar e caracterizar, 50 isolados de P. aerugiosa obtidas de amostras de solo com diferentes culturas provenientes das cinco regiões brasileiras. As bactérias serão avaliadas quanto à resistência aos antimicrobianos e metais pesados e presença genes de virulência. (AU)

CEPEMA - Centro Cooperativo em Engenharia Ambiental

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Escola Politécnica (EP). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Claudio Augusto Oller do Nascimento
Pesquisadores principais:

Maria Anita Mendes ; Reinaldo Giudici ; Roberto Guardani ; Márcio Reis Custódio

Área do conhecimento:Engenharias - Engenharia Química
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo:13/50218-2
Vigência: 01 de maio de 2014 - 30 de abril de 2018
Assunto(s):Microbiologia ambientalEspectroscopia de massaModelos matemáticosRemediação ambientalBiorremediação
Resumo
Centro de Pesquisa e Capacitação em Meio Ambiente, CEPEMA-USP (www.cepema.usp.br) é um centro de pesquisa recém-criado da Universidade de São Paulo (USP), localizado na cidade Cubatão, SP, dedicado à pesquisa e educação ambiental. A principal missão do CEPEMA-USP é o de proporcionar um ambiente multi-disciplinar que servirá para focalizar a pesquisa de todos os setores da Universidade sobre a solução de problemas ambientais do mundo real, em harmonia com os setores público e privado da sociedade. Formalmente associada ao Departamento de Engenharia Química da USP (Escola Politécnica, EP-USP), CEPEMA-USP. A principal missão do CEPEMA-USP é servir como um ponto focal para os esforços de pesquisa que envolvem todos os setores da Universidade de São Paulo. Iniciativas de pesquisa do Centro, que são financiados (pela FAPESP agências de brasileira, CAPES (PROCAD), CNPq e FINEP, por indústrias como Petrobras e Vale e do BNDES) e já consolidadas incluem: a simulação e otimização de processos de interesse da indústria química (Minimização, de impacto ambiental, o uso de energia, etc); melhorias no monitoramento on-line de processos; reuso de água, com a integração de tecnologias; (foto)-remediação de efluentes e resíduos; novos catalisadores para os processos de oxidação avançada; sensoriamento remoto de poluentes atmosféricos, desenvolvimento de modelos de previsão de poluentes atmosféricos; detecção de toxinas e identificação de algas de algas, aplicação de fluidos supercríticos para os problemas ambientais, o transporte e dispersão de poluentes e metais em solos; remediação de solos contaminados; educação ambiental; cursos de especialização para profissionais de Engenharia Química (com aplicação de Meio Ambiente e Gestão Ambiental). (AU)

Utilização do glicerol para produção de biossurfactante por Bacillus subtilis e como co- substrato na biodegradação de diesel e biodiesel em solo

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Instituto de Biociências (IB). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Rio Claro. Rio Claro, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Ederio Dino Bidoia
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Doutorado
Processo:13/13813-0
Vigência: 01 de março de 2014 - 19 de janeiro de 2015
Assunto(s):BiorremediaçãoBioensaioMicrobiologia ambiental
Resumo
O solo tem sido utilizado por gerações como receptor de substâncias resultantes da atividade humana. A liberação descontrolada de poluentes para o ambiente e sua consequente acumulação causou uma mudança drástica no solo, por vezes irreversível, gerada pelo aumento das atividades urbanas, industriais e agrícolas. Em consequência, a degradação causada diminui a fertilidade e as funções do solo associadas à produção de alimentos e de biomassa, à capacidade de suporte da vida e da biodiversidade. Apesar do poder de autodepuração do solo, a contaminação do solo por derivados do petróleo pode acarretar em diversos impactos a todos os organismos que dependem do solo, devido a sua composição tóxica e mutagênica. A biodegradação constitui a mais importante forma de transformação deste composto no ambiente, sendo os micro-organismos ambientais cruciais para a transformação destes contaminantes. No entanto muitos compostos derivados do petróleo são persistentes no ambiente, pois grande parte dos micro-organismos não é capaz de metaboliza-los. Assim a entrada de tais poluentes no ambiente pode causar um impacto na diversidade microbiana do solo. Está persistência de alguns hidrocarbonetos no ambiente pressionou a busca por fontes de energia renovável. Assim o biodiesel já é uma realidade na utilização como combustível. Mas com o grande volume de biodiesel produzido há também a produção de um resíduo, o glicerol. Diversas atividades devem ser propostas para maximizar a utilização deste resíduo de forma que o menor impacto seja causado ao ambiente, além de transforma-lo em produtos com alto valor agregado. Neste sentido a utilização de resíduos pode ser uma proposta para diminuir os custos da produção de biossurfactantes, pois em aplicações ambientais onde há grande demanda, o alto custo do produto inviabilizaria a utilização. Portanto o projeto tem como objetivo a utilização do glicerol para gerar um produto com valor agregado como os biossurfactantes, possibilitando a redução dos custos de produção e avaliar a eficiência deste biossurfactante em ensaios de biodegradação com biodiesel e diesel na presença do glicerol como co-substrato. O trabalho pretende também demonstrar à mudança da diversidade microbiana após a contaminação. O desafio do trabalho é chamar atenção acerca do restabelecimento da qualidade do solo após a contaminação e fornecer informações para a utilização de um resíduo que estará cada vez mais abundante. (AU)

Análise da diversidade funcional e bioprospecção de genes de degradação de hidrocarbonetos e de transformação de metais pesados em sedimentos de manguezal

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Centro Pluridisciplinar de Pesquisas Químicas, Biológicas e Agrícolas (CPQBA). Coordenadoria de Centros e Núcleos Disciplinares (COCEN). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Paulínia, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Valéria Maia de Oliveira
Supervisor no exterior: Matthias Hess
Local de pesquisa: Washington State University (WSU) (Estados Unidos)
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Microbiologia - Microbiologia Aplicada
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Estágio de Pesquisa - Pós-Doutorado
Processo:13/20670-0
Vigência: 01 de fevereiro de 2014 - 30 de junho de 2014
Assunto(s):Microbiologia ambiental
Resumo
O Brasil tem uma das maiores extensões de manguezais do mundo, um ecossistema que possui grande biodiversidade em animais marinhos, aves, répteis, mamíferos e micro-organimos. Embora os manguezais sejam considerados Área de Preservação Permanente, esse ecossistema têm sofrido nos últimos anos as mais diversas ações antrópicas e são freqüentemente atingidos por vazamentos de petróleo e por resíduos industrias contendo metais pesados. Sabe-se que os micro-organismos presentes em ambientes contaminados podem desenvolver mecanismos que permitem a sua sobrevivência na presença de certos poluentes. Apesar da grande diversidade e relevância dos micro-organismos presentes nos manguezais, surpreendentemente, quase nenhuma pesquisa tem sido feita sobre o tema no Brasil. Sabemos que embora as técnicas de cultivo tenham sido aprimoradas e tenham permitido a recuperação in vitro de um número crescente de micro-organismos ainda não cultivados, nosso conhecimento sobre sua ecologia permanece insuficiente para cultivar a maioria deles. Neste contexto, o presente projeto propõe o emprego da abordagem de metatranscriptomica, baseada na extração direta do RNA total da comunidade microbiana a partir de amostras ambientais, aliada à construção de bibliotecas de DNA complementar (cDNA) e subsequente análise dessas bibliotecas, com o intuito de investigar a presença e diversidade de genes metabolicamente ativos de grande relevância na descontaminação de áreas impactadas. Esses estudos podem contribuir para o conhecimento sobre a diversidade funcional e filogenética da microbiota presente nos manguezais brasileiros e levar à descoberta de novos genes envolvidos na degradação de hidrocarbonetos e na transformação de metais pesados, com potencial aplicação em processos biotecnológicos. (AU)

Avaliação de risco à saúde humana a partir de um monitoramento ecotoxicológico, limnológico e microbiológico na Bacia do Rio Pardo (UGRHI04)

Beneficiário:
Instituição-sede da pesquisa: Escola de Enfermagem de Ribeirão Preto (EERP). Universidade de São Paulo (USP). Ribeirão Preto, SP, Brasil
Pesquisador responsável:Susana Segura Muñoz
Área do conhecimento:Ciências da Saúde - Saúde Coletiva - Saúde Pública
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Regular
Processo:13/07238-2
Vigência: 01 de fevereiro de 2014 - 31 de janeiro de 2016
Assunto(s):Saúde ambientalEcotoxicologiaRecursos hídricosBacia hidrográficaMicrobiologia ambientalAvaliação de riscoMonitoramento ambiental
Resumo
No marco dos corpos hídricos superficiais, as bacias hidrográficas são consideradas fundamentais para a aplicação de métodos de avaliação de risco. A Bacia do Pardo (UGRHI 04) abrange 23 municípios com um contingente populacional de cerca de 1.084.000 habitantes. Atividades industriais e agropecuárias na região têm contribuído significativamente para a contaminação dos rios da Bacia do Pardo. Sabe-se que os poluentes disseminados nos rios, de origem biológica e química, podem afetar a saúde humana diretamente por contato dérmico e ingestão. Também, por vias indiretas ao ser introduzidos na cadeia alimentar. O objetivo do presente estudo é avaliar o risco à saúde humana a partir de um monitoramento ecotoxicológico, limnológico e microbiológico do sedimento e água do Rio do Pardo. Amostras e dados serão coletados em 12 pontos em toda a extensão do rio (550 km), incluindo a nascente e a foz. Serão realizadas duas campanhas de coleta na estação seca e duas na estação chuvosa. As concentrações de metais tóxicos serão avaliadas por ICP-MSS, pesticidas por GC-ECD e GC-TSD, bioagentes patogênicos por técnicas de separação imuno-magnética. Testes complementares de ecotoxicidade também serão realizados. Avaliação de Risco para poluentes químicos será realizada para risco cancerígeno e não-cancerígeno. Para a avaliação quantitativa do risco microbiológico (AQRM) será utilizado o modelo exponencial de dose-resposta. O software Crystal Ball será utilizado para a realização das Simulações de Monte Carlo. O Rio Pardo constitui uma fonte potencial de abastecimento público na região, considerando a depleção verificada no volume de água do Aquífero Guarani recentemente. (AU)
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