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Bioinformática para estudos genômicos

Processo: 99/11876-5
Linha de fomento:Bolsas no Exterior - Pesquisa
Vigência (Início): 07 de agosto de 2000
Vigência (Término): 06 de agosto de 2001
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Biologia Molecular
Pesquisador responsável:João Carlos Setubal
Beneficiário:João Carlos Setubal
Anfitrião: Phil Green
Instituição-sede: Instituto de Computação (IC). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas, SP, Brasil
Local de pesquisa : University of Washington, Estados Unidos  
Assunto(s):Biologia computacional   Genômica comparativa   Estudos de associação genética   Genomas

Resumo

O projeto visa fundamentalmente ao aperfeiçoamento do candidato na área de bioinformática para estudos genômicos através de trabalho conjunto com um pesquisador de renome mundial. Este aperfeiçoamento servirá para fortalecer a competência do Laboratório de Bioinformática do Instituto de Computação da Unicamp. Em particular pretende-se desenvolver ferramentas computacionais que deverão ser úteis para os projetos genoma financiados pela FAPESP. O trabalho previsto inclui os seguintes tópicos: 1) Algoritmo e programa para criação de um "scaffold" de auxílio à montagem de um genoma. 2) Ferramenta para comparação detalhada de dois genomas bacterianos completos. 3) Identificação de seqüências codificadoras de genes humanos com base em ESTs e no genoma completo. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
WOOD‚ D.W.; SETUBAL‚ J.C.; KAUL‚ R.; MONKS‚ D.E.; KITAJIMA‚ J.P.; OKURA‚ V.K.; ZHOU‚ Y.; CHEN‚ L.; WOOD‚ G.E.; ALMEIDA JR‚ N.F.; OTHERS. The genome of the natural genetic engineer Agrobacterium tumefaciens C58. Science, v. 294, n. 5550, p. 2317-2323, 2001.

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