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Aplicação de ontologias em estudos de química medicinal computacional e relações entre estrutura química e atividade biológica

Processo: 18/06680-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Mestrado
Vigência (Início): 01 de junho de 2018
Vigência (Término): 31 de maio de 2019
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biofísica - Biofísica Molecular
Convênio/Acordo: IBM Brasil
Pesquisador responsável:Kathia Maria Honorio
Beneficiário:Rafaela Molina de Angelo
Instituição-sede: Escola de Artes, Ciências e Humanidades (EACH). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:16/18840-3 - Aplicação de técnicas de transferência de aprendizagem e ontologias a modelos QSAR para regressão, AP.PITE
Assunto(s):Neoplasias   Relação quantitativa estrutura-atividade   Ontologias (organização da informação)

Resumo

O estudo quantitativo da relação estrutura-atividade (QSAR) envolve a construção de modelos de regressão que relacionam propriedades (descritores) de um conjunto contendo substâncias químicas e dados de atividade biológica com relação a um ou mais alvos biológicos no organismo. Os conjuntos de dados manipulados pelos pesquisadores que utilizam técnicas de QSAR são caracterizados, geralmente, por um número pequeno de instâncias (amostras/compostos) e isso torna mais complexa a construção de modelos preditivos. Nesse contexto, inibidores do alvo biológico ALK-5 serão analisados e serão calculadas propriedades (descritores) para esse conjunto de inibidores de forma que seja possível desenvolver uma ontologia que auxilie a construção e a obtenção de modelos de QSAR de qualidade estatística. Este interesse no uso de ontologias se baseia no fato de que a utilização de uma estruturação (organização) do conhecimento de um determinado domínio é de grande valia para o desenvolvimento de sistemas computacionais mais flexíveis e confiáveis para predição, fazendo com que as informações moleculares dos compostos estudados para este alvo sejam unificadas e padronizadas. Para a aplicação desta ontologia, será necessária uma abordagem para a seleção de conjuntos de dados químicos relacionados ao conjunto alvo por meio do uso de ontologias já existentes. (AU)