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Diferentes métodos de Extração de DNA associados a diferentes períodos de armazenamento de saliva total para obtenção de DNA genômico para sequenciamento direto

Processo: 11/22434-7
Linha de fomento:Bolsas no Brasil - Iniciação Científica
Vigência (Início): 01 de março de 2012
Vigência (Término): 31 de dezembro de 2013
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Genética - Genética Humana e Médica
Pesquisador responsável:Lucimara Teixeira das Neves
Beneficiário:
Instituição-sede : Faculdade de Odontologia de Bauru (FOB). Universidade de São Paulo (USP). Bauru, SP, Brasil
Assunto(s):Saliva   DNA   Biologia molecular   Sequenciamento genético

Resumo

Para se chegar à fase de sequenciamento genético, é necessário que o DNA tenha sido devidamente processado. O primeiro passo é escolher o material de partida para coletar o material genético, ou seja, de que tipo de célula será extraído o DNA, neste caso utilizaremos a saliva para obtenção de células epiteliais da mucosa bucal que se desprenderam, pois a coleta da saliva é um método indolor, não-invasivo, sem risco de transmissão de doenças que não necessita de pessoal especializado para a coleta e que é bem aceito pela maioria das pessoas que participam do estudo, ao contrário do sangue, e além do mais, a saliva pode ser congelada antes da extração do DNA, enquanto que o sangue exige que a extração seja realizada logo após a coleta. A questão do congelamento da saliva é algo que será levado em consideração em nosso estudo, pois, sabemos que a saliva congelada por um pequeno período talvez traga benefícios, pois o congelamento provavelmente inativa enzimas que possam degradar o DNA, porém após um determinado tempo congelada, o material genético passa a ser degradado. Está disponível no mercado um kit comercial que especifica a preservação da saliva antes da extração e possui uma substância conservante que vai sendo liberada no tubo em que a saliva foi armazenada durante o congelamento, este estudo também tem por objetivo utilizá-lo para comprovar sua eficácia. Serão utilizados para extração de DNA vários kits e protocolos estabelecidos, com o objetivo de avaliar a efetividade dos mesmos quanto a quantidade e qualidade de DNA obtido. Assim, o objetivo geral deste projeto de pesquisa é avaliar a qualidade e quantidade de DNA genômico extraído a partir de saliva total com finalidade de sequenciamento direto, enquanto que os objetivos específicos são verificar se diferentes períodos de armazenamento interferem na quantidade e qualidade de DNA de partida com finalidade de sequenciamento direto para investigação de mutações. Além disso, verificar se diferentes protocolos de extração de DNA podem influenciar nestes mesmos fatores, levando-se em conta os diferentes períodos de armazenamento da saliva por congelamento. (AU)

Publicações científicas
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
THAIS FRANCINI GARBIERI; DANIEL THOMAS BROZOSKI; THIAGO JOSÉ DIONÍSIO; CARLOS FERREIRA SANTOS; LUCIMARA TEIXEIRA DAS NEVES. Human DNA extraction from whole saliva that was fresh or stored for 3, 6 or 12 months using five different protocols. Journal of Applied Oral Science, v. 25, n. 2, p. 147-158, Abr. 2017. Citações Web of Science: 0.

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