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EMU concedido no processo 13/08711-3: espectrômetro de massas Waters SYNAPT G2-Si HDMs + nanoACQUITY UPLC

Processo: 14/10068-4
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa Equipamentos Multiusuários
Vigência: 01 de setembro de 2014 - 31 de agosto de 2016
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Bioquímica - Química de Macromoléculas
Pesquisador responsável:Daniel Martins-de-Souza
Beneficiário:
Instituição-sede: Instituto de Biologia (IB). Universidade Estadual de Campinas (UNICAMP). Campinas, SP, Brasil
Vinculado ao auxílio:13/08711-3 - Desenvolvimento de um teste preditivo para medicação bem sucedida e compreensão das bases moleculares da esquizofrenia através da proteômica, AP.JP
Assunto(s):Biomarcadores  Esquizofrenia  Proteômica 
Página web do EMU:http://www.ib.unicamp.br/extensao/espectrometroUPLC
Agendamento de uso:http://goo.gl/4VGyaf

Resumo

O espectrômetro de massas é o coração de um laboratório de proteômica. Análises proteômicas dependem totalmente de um espectrômetro de massas.O equipamento aqui proposto é parte essencial e indispensável para a execução do projeto jovem pesquisador 13/08711-3. Todas as análises propostas por este projeto bem como quaisquer colaborações com outros grupos, dependem deste equipamento, não somente para a identificação e quantificação de proteínas, mas também para seu sequenciamento (top-down proteomics) e análise de modificações pós-traducionais, além da possibilidade de ampliação de suas funções para outros campos do conhecimento, como a metabolômica, que está nos planos para um futuro a médio prazo. A escolha deste sistema foi baseada no fato de que este espetrômetro de massas em particular é capaz de executar uma tarefa que é necessária para a análise de amostras clínicas (data independent analysis) como às que serão utilizadas por este projeto. Os resultados obtidos podem ser analisados separadamente pois a quantificação é feita sem a necessidade de marcação isotópica (label-free), otimizando o poder estatístico dos resultados e consequentemente sua qualidade. Isso aumenta a chance de se revelar dados significativos para futura aplicação na prática clínica. Ainda, a possibilidade de mapeamento de modificações pós-traducionais por mobilidade iônica poderá enriquecer os estudos a serem executados, bem como as análises de "top-down proteomics" utilizando a fragmentação por ETD (Electron-transfer dissociation) por este projeto bem como aumenta sua gama de funções, favorecendo colaborações com outros grupos, que é o intuito principal de um equipamento multiusuário. (AU)

Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Estudo associa esquizofrenia a defeito no processamento do RNA mensageiro na célula 
Equipamentos multiusuários ampliam acesso de pesquisadores a tecnologias de ponta 

Publicações científicas (12)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
ZUCCOLI, GIULIANA S.; SAIA-CEREDA, VERONICA M.; NASCIMENTO, JULIANA M.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. The Energy Metabolism Dysfunction in Psychiatric Disorders Postmortem Brains: Focus on Proteomic Evidence. FRONTIERS IN NEUROSCIENCE, v. 11, SEP 7 2017. Citações Web of Science: 0.
TURCK, CHRISTOPH W.; GUEST, PAUL C.; MACCARRONE, GIUSEPPINA; ISING, MARCUS; KLOIBER, STEFAN; LUCAE, SUSANNE; HOLSBOER, FLORIAN; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Proteomic Differences in Blood Plasma Associated with Antidepressant Treatment Response. FRONTIERS IN MOLECULAR NEUROSCIENCE, v. 10, AUG 31 2017. Citações Web of Science: 0.
DEZONNE, ROMULO SPERDUTO; SARTORE, RAFAELA COSTA; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI; SAIA-CEREDA, VERONICA M.; ROMAO, LUCIANA FERREIRA; ALVES-LEON, SONIZA VIEIRA; DE SOUZA, JORGE MARCONDES; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; REHEN, STEVENS KASTRUP; ALCANTARA GOMES, FLVIA CARVALHO. Derivation of Functional Human Astrocytes from Cerebral Organoids. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, MAR 27 2017. Citações Web of Science: 0.
GARCEZ, PATRICIA P.; NASCIMENTO, JULIANA MINARDI; DE VASCONCELOS, JANAINA MOTA; DA COSTA, RODRIGO MADEIRO; DELVECCHIO, RODRIGO; TRINDADE, PABLO; LOIOLA, ERICK CORREIA; HIGA, LUIZA M.; CASSOLI, JULIANA S.; VITORIA, GABRIELA; SEQUEIRA, PATRICIA C.; SOCHACKI, JAROSLAW; AGUIAR, RENATO S.; FUZII, HELLEN THAIS; BISPO DE FILIPPIS, ANA M.; GONCALVES VIANEZ JUNIOR, JOAO LIDIO DA SILVA; TANURI, AMILCAR; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; REHEN, STEVENS K. Zika virus disrupts molecular fingerprinting of human neurospheres. SCIENTIFIC REPORTS, v. 7, JAN 23 2017. Citações Web of Science: 4.
CAFE-MENDES, C. C.; FERRO, E. S.; TORRAO, A. S.; CRUNFLI, F.; RIOLI, V.; SCHMITT, A.; FALKAI, P.; BRITTO, L. R.; TURCK, C. W.; MARTINS-DE-SOUZA, D. Peptidomic analysis of the anterior temporal lobe and corpus callosum from schizophrenia patients. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 151, n. SI, p. 97-105, JAN 16 2017. Citações Web of Science: 3.
TAVARES, RAPHAEL; WAJNBERG, GABRIEL; SCHERER, NICOLE DE MIRANDA; PAULETTI, BIANCA ALVES; CASSOLI, JULIANA S.; FERREIRA, CARLOS GIL; PAES LEME, ADRIANA FRANCO; DE ARAUJO-SOUZA, PATRICIA SAVIO; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; PASSETTI, FABIO. Unveiling alterative splice diversity from human oligodendrocyte proteome data. JOURNAL OF PROTEOMICS, v. 151, n. SI, p. 293-301, JAN 16 2017. Citações Web of Science: 0.
SCHMITT, ANDREA; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; AKBARIAN, SCHAHRAM; CASSOLI, JULIANA S.; EHRENREICH, HANNELORE; FISCHER, ANDRE; FONTEH, ALFRED; GATTAZ, WAGNER F.; GAWLIK, MICHAEL; GERLACH, MANFRED; GRUNBLATT, EDNA; HALENE, TOBIAS; HASAN, ALKOMIET; HASHIMOTO, KENIJ; KIM, YONG-KU; KIRCHNER, SOPHIE-KATHRIN; KORNHUBER, JOHANNES; KRAUS, THEO F. J.; MALCHOW, BEREND; NASCIMENTO, JULIANA M.; ROSSNER, MORITZ; SCHWARZ, MARKUS; STEINER, JOHANN; TALIB, LEDA; THIBAUT, FLORENCE; RIEDERER, PETER; FALKAI, PETER; FORCE, MEMBERS WFSBP TASK. Consensus paper of the WFSBP Task Force on Biological Markers: Criteria for biomarkers and endophenotypes of schizophrenia, part III: Molecular mechanisms. WORLD JOURNAL OF BIOLOGICAL PSYCHIATRY, v. 18, n. 5, p. 330-356, 2017. Citações Web of Science: 0.
SAIA-CEREDA, VERONICA M.; CASSOLI, JULIANA S.; SCHMITT, ANDREA; FALKAI, PETER; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Differential proteome and phosphoproteome may impact cell signaling in the corpus callosum of schizophrenia patients. SCHIZOPHRENIA RESEARCH, v. 177, n. 1-3, p. 70-77, NOV 2016. Citações Web of Science: 3.
VENDRAMINI, PEDRO H.; GATTAZ, WAGNER F.; SCHMITT, ANDREA; FALKAI, PETER; EBERLIN, MARCOS N.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Pioneering ambient mass spectrometry imaging in psychiatry: Potential for new insights into schizophrenia. SCHIZOPHRENIA RESEARCH, v. 177, n. 1-3, p. 67-69, NOV 2016. Citações Web of Science: 2.
CASSOLI, JULIANA S.; IWATA, KEIKO; STEINER, JOHANN; GUEST, PAUL C.; TURCK, CHRISTOPH W.; NASCIMENTO, JULIANA M.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Effect of MK-801 and Clozapine on the Proteome of Cultured Human Oligodendrocytes. FRONTIERS IN CELLULAR NEUROSCIENCE, v. 10, MAR 3 2016. Citações Web of Science: 5.
MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL; CASSOLI, JULIANA S.; NASCIMENTO, JULIANA M.; HENSLEY, KENNETH; GUEST, PAUL C.; PINZON-VELASCO, ANDRES M.; TURCK, CHRISTOPH W. The protein interactome of collapsin response mediator protein-2 (CRMP2/DPYSL2) reveals novel partner proteins in brain tissue. PROTEOMICS CLINICAL APPLICATIONS, v. 9, n. 9-10, SI, p. 817-831, OCT 2015. Citações Web of Science: 8.
SAIA-CEREDA, VERONICA M.; CASSOLI, JULIANA S.; SCHMITT, ANDREA; FALKAI, PETER; NASCIMENTO, JULIANA M.; MARTINS-DE-SOUZA, DANIEL. Proteomics of the corpus callosum unravel pivotal players in the dysfunction of cell signaling, structure, and myelination in schizophrenia brains. EUROPEAN ARCHIVES OF PSYCHIATRY AND CLINICAL NEUROSCIENCE, v. 265, n. 7, p. 601-612, OCT 2015. Citações Web of Science: 20.

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