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Decifrando as grandes tendências de evolução molecular e morfológica nos Amoebozoa

Processo: 13/04585-3
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Apoio a Jovens Pesquisadores
Vigência: 01 de dezembro de 2013 - 30 de novembro de 2017
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Zoologia
Pesquisador responsável:Daniel José Galafasse Lahr
Beneficiário:
Instituição-sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Bolsa(s) vinculada(s):16/03193-2 - Auxílio na produção e gerenciamento de dados moleculares dos Amoebozoa, BP.TT
15/02689-1 - Experimentos de exclusão competitiva em protistas, BP.IC
14/12822-8 - Auxílio na produção e gerenciamento de dados moleculares dos Amoebozoa para o período inicial do Projeto JP, BP.TT
13/25729-3 - Variação morfológica temporal de tecamebas (Arcella vulgaris e Arcella gibbosa) em populações naturais e linhagens clonais, BP.IC
Assunto(s):

Transcriptoma

Filogenia

Actinas

Duplicação gênica

Evolução molecular

Resumo
O projeto proposto pretende iniciar a caracterização a diversidade dos Amoebozoa no Brasil, integrando aspectos de protistologia tradicional de estudo morfológico com técnicas moleculares inovadoras. Organismos serão isolados de corpos d'água doce e marinho, de modo a capturar de maneira abrangente a diversidade de organismos ainda inexplorada no território nacional. Os organismos coletados serão submetidos à duas principais estratégias de estudo: 1) os organismos que não permitem cultura em laboratório serão foto-documentados e submetidos à processo de amplificação genômica a partir de uma única célula; e 2) os organismos que permitem cultura em laboratório serão cultivados de maneira monoxênica para geração de grandes quantidades de DNA e também geração de bibliotecas de cDNA para piro-sequenciamento do transcriptoma em plataforma Illumina. Muitos dos organismos assim estudados serão espécies novas ou pouco conhecidas, que serão descritas individualmente com estudos detalhados de microscopia eletrônica e análise filogenética baseada em concatenação de múltiplos genes (no mínimo 4 genes: subunidade ribossomal 18s, actina, alfa e beta tubulina). Outros organismos encontrados serão utilizados para caracterização de 8-10 genes utilizados em reconstruções filogenéticas abrangentes de eucariontes, com o objetivo de gerar filogenias com ênfase nas relações basais dos Amoebozoa. Os organismos cujos transcriptomas foram sequenciados serão utilizados para compreensão mais profunda sobre padrões de evolução por duplicação gênica nos Amoebozoa, com enfoque especial na família gênica de actina. Finalmente, os dados fotográficos, videográficos e moleculares gerados serão disseminados a partir de publicação de artigos em revistas de projeção internacional e também com a criação de websites voltados a divulgação do conhecimento para o público leigo. (AU)
Matéria(s) publicada(s) na Agência FAPESP sobre o auxílio:
Nova espécie de ameba homenageia personagem de <i>O Senhor dos Anéis</i>

Publicações científicas (4)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
KOSAKYAN, ANUSH; LAHR, DANIEL J. G.; MULOT, MATTHIEU; MEISTERFELD, RALF; MITCHELL, EDWARD A. D.; LARA, ENRIQUE. Phylogenetic reconstruction based on COI reshuffles the taxonomy of hyalosphenid shelled (testate) amoebae and reveals the convoluted evolution of shell plate shapes. CLADISTICS, v. 32, n. 6, p. 606-623, DEC 2016. Citações Web of Science: 0.
FUCIKOVA, KAROLINA; LAHR, DANIEL J. G. Uncovering Cryptic Diversity in Two Amoebozoan Species Using Complete Mitochondrial Genome Sequences. Journal of Eukaryotic Microbiology, v. 63, n. 1, p. 112-122, JAN-FEB 2016. Citações Web of Science: 1.
LAHR, DANIEL J. G.; BOSAK, TANJA; LARA, ENRIQUE; MITCHELL, EDWARD A. D. The Phanerozoic diversification of silica-cycling testate amoebae and its possible links to changes in terrestrial ecosystems. PeerJ, v. 3, SEP 8 2015. Citações Web of Science: 3.
LAHR, DANIEL J. G.; LAUGHINGHOUSE, HAYWOOD DAIL; OLIVERIO, ANGELA M.; GAO, FENG; KATZ, LAURA A. How discordant morphological and molecular evolution among microorganisms can revise our notions of biodiversity on Earth. BIOESSAYS, v. 36, n. 10, p. 950-959, OCT 2014. Citações Web of Science: 8.
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