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Dimensions US-BIOTA São Paulo: integrando disciplinas para a predição da biodiversidade da Floresta Atlântica no Brasil

Pesquisador responsável:

Cristina Yumi Miyaki

Beneficiário:

Instituição-sede da pesquisa: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Pesquisador responsável no exterior: Ana Carolina O. Queiroz Carnaval
Instituição no exterior: City University of New York (CUNY), Estados Unidos
Pesquisadores principais:

Ricardo Pinto da Rocha ; Francisco William da Cruz Junior

Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biologia Geral
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa BIOTA - Temático
Processo: 13/50297-0
Vigência: 01 de setembro de 2013 - 31 de agosto de 2018
Bolsa(s) vinculada(s):15/25325-5 - Evolução dos aracnídeos da ordem Opiliones na Floresta Atlântica brasileira: uma abordagem em nível de populações até níveis taxonômicos elevados (Arachnida, Opiliones, Gonyleptidae), BE.PQ
15/14327-7 - Paleoclimatologia e estudo da dinâmica atual em sistemas cársticos do Brasil Central: implicações para interpretações paleoclimáticas com base em registros de espeleotemas, BP.PD
15/03615-1 - Dimensões US- biota - São Paulo: um quadro multidisciplinar para a previsão da biodiversidade no hotspot Mata Atlântica brasileira, BP.TT
+ mais bolsas vinculadas 14/10914-2 - Troca de fauna entre as florestas Atlântica e Amazônica: filogenia e biogeografia dos gêneros Xipholena e Cotinga (Passeriformes: Cotingidae) baseado em milhares de locos, BP.PD
14/07407-1 - Dimensions US-BIOTA São Paulo: integrando disciplinas para a predição da biodiversidade da Floresta Atlântica no Brasil, BP.TT
13/24645-0 - Zona híbrida e demografia histórica comparada de três espécies de aves em uma zona de contato na Floresta Atlântica, BP.DR
13/23736-2 - Diversidade alfa, beta, funcional e filogenética de opiliões na Mata Atlântica: padrões e relação com fatores ecológicos e históricos, BP.PD
12/08576-6 - Parasitas de Malária em um suboscine Sul Americano: avaliando a influência da distância geográfica e filogeografia do hospedeiro na prevalência, diversidade, e organização da comunidade de parasitas dentro e entre regiões biogeográficas, BP.PD - menos bolsas vinculadas
Convênio/Acordo de cooperação com a FAPESP: NSF - Dimensions of Biodiversity e BIOTA
Assunto(s):

Ecologia vegetal

Evolução vegetal

Geologia

Botânica (classificação)

Resumo
Será utilizado um processo de teste de hipótese para prever padrões espaciais de Biodiversidade na megadiversa e acessível, porém ameaçada Mata Atlântica (MA) do Brasil. Como forma de caracterizar padrões espaciais de diversidade, serão gerados e integrados: 1. Novos conjuntos de dados de clima e de cobertura vegetal baseados em sensoriamente remoto e combinados com dados meteorológicos, 2. Dados de localidades, filogenia e análises genômicas de mais de 30 famílias de plantas, vertebrados e invertebrados, 3. Informação sobre características funcionais (fisiologia) e interações bióticas, e 4. Informação paleoambiental oriunda de registros geológicos, incluindo o de pólen fóssil e os isótopos de espeleotemas (para inferir mudanças na precipitação baseadas em depósitos em cavernas). Para descrever padrões espaciais de diversidade na MA, faremos a síntese de como a diversidade taxonômica está distribuída espacialmente pela integração de dados de produtores, consumidores, parasitas e bactérias simbiontes. Vamos expandir análises filogenéticas e compilar padrões gerais de endemismo e mudanças (turnover), ao nível de espécies e linhagens. Como forma de avançar a predição de biodiversidade, informações sobre mecanismos ecológicos da fauna e flora da MA (a dimensão funcional da diversidade) serão integradas com modelos climáticos dinâmicos para descrever a variabilidade de precipitação e temperatura durante os últimos seis ciclos glaciais-interglaciais. Esses modelos serão obtidos baseados em estudos paleoclimatológicos que incluirão nossos dados de pólen e espeloetemas fósseis. Por meio de métodos de Computação Bayesiana Aproximada serão utilizados dados de diversidade genética e genômica (Ultra Conserved Elements) dos múltiplos táxons para testar estatisticamente quanto o conjunto dessas histórias populacionais são concordantes com as mudanças ambientais e os processos demográficos. Estes modelos permitirão descrever diferenças entre comunidades devido a mudanças geográficas e ambientais no tempo. (AU)
Matéria(s) publicada(s) na Revista Pesquisa FAPESP sobre o auxílio:
Para entender a origem da floresta

Publicações científicas (33)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
BATALHA-FILHO, HENRIQUE; MIYAKI, CRISTINA Y. Late Pleistocene divergence and postglacial expansion in the Brazilian Atlantic Forest: multilocus phylogeography of Rhopias gularis (Aves: Passeriformes). JOURNAL OF ZOOLOGICAL SYSTEMATICS AND EVOLUTIONARY RESEARCH, v. 54, n. 2, p. 137-147, MAY 2016. Citações Web of Science: 2.
TALAVERA, GERARD; KAMINSKI, LUCAS A.; FREITAS, ANDRE V. L.; VILA, ROGER. One-note samba: the biogeographical history of the relict Brazilian butterfly Elkalyce cogina. Journal of Biogeography, v. 43, n. 4, p. 727-737, APR 2016. Citações Web of Science: 0.
LEDRU, MARIE-PIERRE; MONTADE, VINCENT; BLANCHARD, GREGOIRE; HELY, CHRISTELLE. Long-term Spatial Changes in the Distribution of the Brazilian Atlantic Forest. Biotropica, v. 48, n. 2, p. 159-169, MAR 2016. Citações Web of Science: 0.
BROWN, JASON L.; WEBER, JENNIFER J.; ALVARADO-SERRANO, DIEGO F.; HICKERSON, MICHAEL J.; FRANKS, STEVEN J.; CARNAVAL, ANA C. Predicting the genetic consequences of future climate change: The power of coupling spatial demography, the coalescent, and historical landscape changes. AMERICAN JOURNAL OF BOTANY, v. 103, n. 1, p. 153-163, JAN 2016. Citações Web of Science: 1.
TEIXEIRA, JR., MAURO; PRATES, IVAN; NISA, CAROLINA; CAMARAO SILVA-MARTINS, NATHALIA SUZAN; STRUESSMANN, CHRISTINE; RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT. Molecular data reveal spatial and temporal patterns of diversification and a cryptic new species of lowland Stenocercus Dumeril & Bibron, 1837 (Squamata: Tropiduridae). Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 94, n. A, p. 410-423, JAN 2016. Citações Web of Science: 0.
DASILVA, MARCIO BERNARDINO; PINTO-DA-ROCHA, RICARDO; DESOUZA, ADRIANO MEDEIROS. A protocol for the delimitation of areas of endemism and the historical regionalization of the Brazilian Atlantic Rain Forest using harvestmen distribution data. CLADISTICS, v. 31, n. 6, p. 692-705, DEC 2015. Citações Web of Science: 3.
KAMINSKI, LUCAS A.; SOARES, GLORIA R.; SERAPHIM, NOEMY; WAHLBERG, NIKLAS; MARINI-FILHO, ONILDO J.; FREITAS, ANDRE V. L. Natural history and systematic position of Rhetus belphegor (n. comb.) (Lepidoptera: Riodinidae), an endangered butterfly with narrow distribution in Southeast Brazil. Journal of Insect Conservation, v. 19, n. 6, p. 1141-1151, DEC 2015. Citações Web of Science: 0.
XUE, ALEXANDER T.; HICKERSON, MICHAEL J. The aggregate site frequency spectrum for comparative population genomic inference. Molecular Ecology, v. 24, n. 24, p. 6223-6240, DEC 2015. Citações Web of Science: 0.
TOURINHO, ANA LUCIA; PINTO-DA-ROCHA, RICARDO; BRAGAGNOLO, CIBELE. Taxonomic notes on Holcobunus Roewer, 1910, with descriptions of three new species, and new records for Holcobunus nigripalpis Roewer, 1910 (Opiliones: Eupnoi: Sclerosomatidae). Zootaxa, v. 4027, n. 3, p. 425-436, OCT 5 2015. Citações Web of Science: 0.
DEMOS, TERRENCE C.; PETERHANS, JULIAN C. KERBIS; JOSEPH, TYLER A.; ROBINSON, JOHN D.; AGWANDA, BERNARD; HICKERSON, MICHAEL J. Comparative Population Genomics of African Montane Forest Mammals Support Population Persistence across a Climatic Gradient and Quaternary Climatic Cycles. PLoS One, v. 10, n. 9 SEP 22 2015. Citações Web of Science: 0.
DO AMARAL, FABIO RAPOSO; NEVES, LEANDRO G.; RESENDE, JR., MARCIO F. R.; MOBILI, FLAVIA; MIYAKI, CRISTINA Y.; PELLEGRINO, KATIA C. M.; BIONDO, CIBELE. Ultraconserved Elements Sequencing as a Low-Cost Source of Complete Mitochondrial Genomes and Microsatellite Markers in Non-Model Amniotes. PLoS One, v. 10, n. 9 SEP 17 2015. Citações Web of Science: 1.
BARBOSA, EDUARDO P.; SILVA, ANA K.; PALUCH, MARLON; AZEREDO-ESPIN, ANA MARIA L.; FREITAS, ANDRE V. L. Uncovering the hidden diversity of the Neotropical butterfly genus Yphthimoides Forster (Nymphalidae: Satyrinae): description of three new species based on morphological and molecular data. ORGANISMS DIVERSITY & EVOLUTION, v. 15, n. 3, p. 577-589, SEP 2015. Citações Web of Science: 0.
MELO PACHECO DE MEDEIROS, MARIA CLAUDIA; GUISAN, ANTOINE; LOHMANN, LUCIA G. Climate niche conservatism does not explain restricted distribution patterns in Tynanthus (Bignonieae, Bignoniaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, v. 179, n. 1, p. 95-109, SEP 2015. Citações Web of Science: 0.
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VILLARREAL, OSVALDO M.; KURY, ADRIANO B.; PINTO-DA-ROCHA, RICARDO. The poorly known genus Ventrifurca Roewer, 1913 revisited (Opiliones: Cranaidae). ZOOLOGICAL STUDIES, v. 54, JUN 2015. Citações Web of Science: 0.
WERNECK, FERNANDA P.; LEITE, RAFAEL N.; GEURGAS, SILVIA R.; RODRIGUES, MIGUEL T. Biogeographic history and cryptic diversity of saxicolous Tropiduridae lizards endemic to the semiarid Caatinga. BMC Evolutionary Biology, v. 15, MAY 23 2015. Citações Web of Science: 3.
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MENDONCA DANTAS, GISELE PIRES; REIS SARI, ELOISA HELENA; CABANNE, GUSTAVO SEBASTIAN; PESSOA, RODRIGO OLIVEIRA; MARINI, MIGUEL ANGELO; MIYAKI, CRISTINA YUMI; SANTOS, FABRICIO RODRIGUES. Population genetic structure of the Atlantic Forest endemic Conopophaga lineata (Passeriformes: Conopophagidae) reveals a contact zone in the Atlantic Forest. JOURNAL OF ORNITHOLOGY, v. 156, n. 1, p. 85-99, JAN 2015. Citações Web of Science: 1.
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PINTO-DA-ROCHA, RICARDO; DA FONSECA-FERREIRA, RAFAEL; BICHUETTE, MARIA ELINA. A new highly specialized cave harvestman from Brazil and the first blind species of the genus: landumoema smeagol sp n. (Arachnida, Opiliones, Gonyleptidae). ZOOKEYS, n. 537, p. 79-95, 2015. Citações Web of Science: 0.
CABANNE, GUSTAVO S.; TRUJILLO-ARIAS, NATALIA; CALDERON, LUCIANO; D'HORTA, FERNANDO M.; MIYAKI, CRISTINA Y. Phenotypic evolution of an Atlantic Forest passerine (Xiphorhynchus fuscus): biogeographic and systematic implications. Biological Journal of the Linnean Society, v. 113, n. 4, p. 1047-1066, DEC 2014. Citações Web of Science: 1.
MORI, BRUNO JACOB; PINTO-DA-ROCHA, RICARDO. Taxonomic revision of Parampheres (Arachnida: Opiliones: Gonyleptidae). Zoologia, v. 31, n. 6, p. 541-556, DEC 2014. Citações Web of Science: 0.
RODRIGUES, MIGUEL TREFAUT; VINA BERTOLOTTO, CAROLINA ELENA; AMARO, RENATA CECILIA; YONENAGA-YASSUDA, YATIYO; XAVIER FREIRE, ELIZA MARIA; MACHADO PELLEGRINO, KATIA CRISTINA. Molecular phylogeny, species limits, and biogeography of the Brazilian endemic lizard genus Enyalius (Squamata: Leiosauridae): An example of the historical relationship between Atlantic Forests and Amazonia. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 81, p. 137-146, DEC 2014. Citações Web of Science: 4.
CARNAVAL, ANA CAROLINA; WALTARI, ERIC; RODRIGUES, MIGUEL T.; ROSAUER, DAN; VANDERWAL, JEREMY; DAMASCENO, ROBERTA; PRATES, IVAN; STRANGAS, MARIA; SPANOS, ZOE; RIVERA, DANIELLE; PIE, MARCIO R.; FIRKOWSKI, CARINA R.; BORNSCHEIN, MARCOS R.; RIBEIRO, LUIZ F.; MORITZ, CRAIG. Prediction of phylogeographic endemism in an environmentally complex biome. PROCEEDINGS OF THE ROYAL SOCIETY B-BIOLOGICAL SCIENCES, v. 281, n. 1792 OCT 7 2014. Citações Web of Science: 21.
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BATALHA-FILHO, HENRIQUE; PESSOA, RODRIGO O.; FABRE, PIERRE-HENRI; FJELDSA, JON; IRESTEDT, MARTIN; ERICSON, PER G. P.; SILVEIRA, LUIS F.; MIYAKI, CRISTINA Y. Phylogeny and historical biogeography of gnateaters (Passeriformes, Conopophagidae) in the South America forests. Molecular Phylogenetics and Evolution, v. 79, p. 422-432, OCT 2014. Citações Web of Science: 2.
WALTARI, ERIC; SCHROEDER, RONNY; MCDONALD, KYLE; ANDERSON, ROBERT P.; CARNAVAL, ANA. Bioclimatic variables derived from remote sensing: assessment and application for species distribution modelling. METHODS IN ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 5, n. 10, p. 1033-1042, OCT 2014. Citações Web of Science: 1.
BROWN, JASON L. SDMtoolbox: a python-based GIS toolkit for landscape genetic, biogeographic and species distribution model analyses. METHODS IN ECOLOGY AND EVOLUTION, v. 5, n. 7, p. 694-700, JUL 2014. Citações Web of Science: 31.
DE MEDEIROS, MARIA CLAUDIA M. P.; LOHMANN, LUCIA G. Two new species of Tynanthus Miers (Bignonieae, Bignoniaceae) from Brazil. PHYTOKEYS, v. 42, p. 77-85, 2014. Citações Web of Science: 0.
ZUNTINI, ALEXANDRE R.; LOHMANN, LUCIA G. Synopsis of Martinella Baill. (Bignonieae, Bignoniaceae), with the description of a new species from the Atlantic Forest of Brazil. PHYTOKEYS, v. 37, p. 15-24, 2014. Citações Web of Science: 1.
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