Uso da abordagem de biologia de sistemas para desenvolver um modelo de funcionamento em plantas

• Processo: 11/52065-3
• Modalidade de apoio: Auxílio à Pesquisa - Parceria para Inovação Tecnológica - PITE
• Data de Início da vigência: 01 de outubro de 2012
• Data de Término da vigência: 31 de março de 2017
• Área do conhecimento: Ciências Biológicas - Botânica - Fisiologia Vegetal
• Acordo de Cooperação: Microsoft Research
• Pesquisador responsável: Marcos Silveira Buckeridge
• Beneficiário: Marcos Silveira Buckeridge
• Instituição Sede: Instituto de Biociências (IB). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo , SP, Brasil
• Município da Instituição Sede: São Paulo
• Instituição parceira: Microsoft
• Auxílio(s) vinculado(s): 13/50316-4 - Impact of elevated CO2 and drought on metabolism of Sorghum, AP.R
• Bolsa(s) vinculada(s): 15/13479-8 - Uso de biologia de sistemas para desenvolvimento de modelo para funcionamento de plantas, BP.PD; 13/24205-0 - Desenvolvimento de uma ferramenta de bioinformática para integração das escalas de transcrição gênica, proteômica e fisiologia utilizando sorgo e cana-de-açúcar como sistemas modelos, BP.DR
• Assunto(s): Biologia de sistemas Mudança climática
• Palavra(s)-Chave do Pesquisador: Biologia De Sistemas | Integracao De Dados | Mudancas Climaticas Globais
• Publicação FAPESP: https://media.fapesp.br/bv/uploads/pdfs/World...Impact_10_26_27.pdf

Resumo

O avanço de setores da ciência como as Mudanças Climáticas Globais e a Bioenergia requerem o conhecimento profundo de como as plantas respondem ao ambiente em mudança. Ainda que plantas modelo e nativas tenham sido estudadas do ponto de vista da ecofisiologia, bioquímica e biologia molecular, as abordagens têm sido feitas em um ou dois níveis de organização, sendo que uma limitação é a grande quantidade de dados produzida. A presente proposta pretende expandir estudos utilizando o sorgo como planta modelo, de maneira a integrar o funcionamento deste de forma integrada em diferentes níveis de organização. Pretendemos obter dados de fisiologia, metabolismo e expressão gênica em quadro condições: [CO2] ambiente, [CO2] elevado; [CO2] ambiente com déficit hídrico e [CO2] elevado com déficit hídrico. Dois grupos de pesquisa em biologia de plantas interagirão com um grupo de matemática e ciência da computação com a finalidade de atingir as seguintes metas: 1) testar e refinar ferramentas de análise de redes em biologia; 2) desenvolver ferramentas de integração de dados a partir de experimentos biológicos; 3) desenvolver ferramentas de visualização; 4) tentar extrapolar as análises para outras espécies vegetais. (AU)

Publicações científicas

(4)

(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)

DE SOUZA, AMANDA P.; COCURON, JEAN-CHRISTOPHE; GARCIA, ANA CAROLINA; ALONSO, ANA PAULA; BUCKERIDGE, MARCOS S.. Changes in Whole-Plant Metabolism during the Grain-Filling Stage in Sorghum Grown under Elevated CO2 and Drought. Plant Physiology, v. 169, n. 3, p. 1755-1765, NOV 2015. (13/50316-4, 11/52065-3)

TAVARES, EVELINE Q. P.; BUCKERIDGE, MARCOS S.. Do plant cell walls have a code?. Plant Science, v. 241, p. 286-294, DEC 2015. (15/13479-8, 11/52065-3)

LOCOSSELLI, GIULIANO MASELLI; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. Dendrobiochemistry, a missing link to further understand carbon allocation during growth and decline of trees. TREES-STRUCTURE AND FUNCTION, v. 31, n. 6, p. 1745-1758, DEC 2017. (15/25511-3, 11/52065-3, 13/21728-2)

DE PINHO TAVARES, EVELINE QUEIROZ; MATTOS MARTINS, MARINA CAMARA; GRANDIS, ADRIANA; ROMIM, GRAYCE H.; PIOVEZANI, AMANDA RUSISKA; GAIARSA, JONAS WEISSMANN; BUCKERIDGE, MARCOS SILVEIRA. Newly identified miRNAs may contribute to aerenchyma formation in sugarcane roots. PLANT DIRECT, v. 4, n. 3, MAR 2020. (15/13479-8, 11/52065-3, 08/57908-6, 14/50884-5)