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Ferramentas genômicas no melhoramento genético de características de importância econômica direta em bovinos da raça Nelore

Pesquisador responsável:

Lucia Galvão de Albuquerque

Beneficiário:

Instituição-sede da pesquisa: Faculdade de Ciências Agrárias e Veterinárias (FCAV). Universidade Estadual Paulista (UNESP). Campus de Jaboticabal. Jaboticabal, SP, Brasil
Pesquisadores principais:

Maria Eugênia Zerlotti Mercadante

Pesquisadores associados:

Fabio Ricardo Pablos de Souza ; Henrique Nunes de Oliveira ; Sarah Figueiredo Martins Bonilha ; Luis Artur Loyola Chardulo ; José Fernando Garcia ; Fernando Flores Cardoso ; Joslaine Noely dos Santos Goncalves Cyrillo ; Guilherme Jordão de Magalhães Rosa ; Jesus Aparecido Ferro ; Humberto Tonhati ; Maria Eugênia Zerlotti Mercadante ; Fernando Sebastián Baldi Rey ; Renata Helena Branco Arnandes ; Ricardo da Fonseca ; Flávio Schramm Schenkel

Área do conhecimento:Ciências Agrárias - Zootecnia - Genética e Melhoramento dos Animais Domésticos
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Temático
Processo: 09/16118-5
Vigência: 01 de fevereiro de 2011 - 31 de janeiro de 2017
Bolsa(s) vinculada(s):16/09669-9 - Práticas para a obtenção das características de carcaça e carne em bovinos Nelore, BP.TT
16/02366-0 - Busca por estruturas causais usando modelos gráficos na raça Nelore, BP.DR
15/25356-8 - Estimação da interação genótipo-ambiente utilizando norma de reação genômica e análise da rede gênica para características reprodutivas de bovinos da raça Nelore, BP.DR
+ mais bolsas vinculadas 15/12148-8 - Práticas para a obtenção das características de carcaça e carne em bovinos Nelore, BP.TT
15/06140-4 - Utilização da metodologia single-step para estimação de valores genômicos de características de interesse econômico em bovinos da raça Nelore, BP.PD
14/17646-3 - Práticas para a obtenção e características de carcaça e carne em bovinos Nelore, BP.TT
14/11537-8 - Estratégias de aplicação da seleção genômica em programas de melhoramento de bovinos de corte, BP.PD
14/00779-0 - Modelos estatísticos semi-paramétricos para análise de características complexas utilizando dados genômicos de bovinos da raça Nelore, BP.DR
13/26264-4 - Efeito da utilização de diferentes critérios de controle de qualidade dos genótipos em estudos de associação e seleção genômica ampla, BP.MS
13/25910-0 - Avaliação de estratégias de genotipagem em situações de incerteza de paternidade e seu impacto sobre as avaliações genômicas em bovinos de corte, BP.DR
13/21845-9 - Utilização da metodologia single-step para estimação de valores genômicos de características de interesse econômico em bovinos da raça Nelore, BP.PD
13/25621-8 - Distribuições normais/independentes na predição genômica ampla de características complexas, BP.PD
13/23402-7 - Práticas para a obtenção das características de carcaça e carne em bovinos Nelore, BP.TT
13/01228-5 - Seleção genômica para características de eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore, BP.DR
13/09190-7 - Expressão diferencial de genes ligados à maciez da carne em bovinos Nelore, BP.DR
13/00848-0 - Seleção genômica para precocidade sexual de fêmeas da raça Nelore, BP.DR
12/24600-4 - Identificação de assinaturas de seleção em três linhagens de bovinos Nelore selecionadas para crescimento, BP.DR
13/00035-9 - "detecção de QTLs e busca por mutações causais em genes candidatos para maciez da carne em bovinos da raça Nelore", BP.DR
12/21969-7 - Utilização de informações genômicas para o melhoramento genético de características da carne em bovinos da raça Nelore, BP.DR
10/14580-0 - Estudo da associação entre polimorfismos de base única com características da carcaça e da carne em bovinos da raça Nelore utilizando painéis de alta densidade, BP.MS
10/14675-1 - Estudo da associação genética entre características da carcaça e carne com características de crescimento em bovinos da raça Nelore, BP.MS
11/14850-0 - Caracterização das proteínas µ-calpaína, m-calpaína e calpastatina e sua relação com as características de qualidade de carne em animais da raça Nelore (Bos indicus) selecionados para a produção, BP.MS
11/09393-0 - Estudo de diferentes estratégias de genotipagem seletiva e comparação de modelos para predição de valores genômicos usando dados simulados, BP.PD
11/01811-7 - Seleção genômica para características relacionadas à eficiência reprodutiva de fêmeas da raça Nelore, BP.DR - menos bolsas vinculadas
Assunto(s):

Seleção genética

Expressão gênica

Genômica

Bovinos de corte

Gado Nelore

Resumo
A pecuária brasileira é uma atividade que apresenta extrema importância socioeconômica no Brasil e no mundo. No mercado internacional da carne, existe uma tendência para a valorização de produtos cárneos diferenciados (produtos com maior valor agregado), em termos de propriedades organolépticas da carne e consequências de seu consumo sobre a saúde humana. Além disto, existe uma preocupação crescente pelo impacto ambiental da produção pecuária e pela competição por alimentos, grãos e suplementos, que são utilizados tanto pela população humana como pelos bovinos. Neste cenário mundial, visando tornar a atividade pecuária economicamente rentável e sustentável, ganham importância as características associadas à qualidade da carcaça e carne, bem como as características indicadoras de eficiência alimentar. Atualmente, as características da carcaça e carne, assim como as associadas à eficiência alimentar, não têm sido consideradas nos programas de avaliação genética em virtude do alto custo e dificuldade de mensuração. No país, existem algumas instituições de pesquisa que vêm coletando informações fenotípicas para estas características, principalmente para carcaça e carne. Entretanto, trabalhos de quantitativa, com estimativas de parâmetros genéticos para estas características são raros. Além disto, dada à dificuldade de coleta de dados, em geral, as amostras são pequenas e há necessidade de um maior número de estimativas destes parâmetros antes que estas características possam ser utilizadas para seleção. Os importantes avanços nas técnicas de genética molecular, com o desenvolvimento de um painel de marcadores de polimorfismos de base única (SNP´s) de alta densidade, permitirão ganhos genéticos significativos, sobretudo em características de alto custo e de difícil mensuração, como é o caso das características de carcaça e carne bem como da eficiência de conversão alimentar. Cabe ressaltar que os efeitos dos SNP’s são estimados e Procura-se com este projeto criar um banco de dados de características de qualidade de carcaça e carne e de eficiência alimentar, bem como utilizar uma base de dados de características de importância econômica que, normalmente, são contempladas em programas de melhoramento genético de gado de corte, como as características de crescimento e reprodutivas, para a detecção de polimorfismos de DNA associados a estas características e desenvolvimento de métodos e softwares visando seleção genômica. Para alcançar este objetivo serão desenvolvidos os seguintes tópicos no projeto: a) Análise genética quantitativa de características de carcaça, carne e eficiência alimentar e suas associações com outras características de importância econômica. b) Estudo de associação de polimorfismos de base única (SNP) com características de importância econômica em bovinos da raça Nelore). Estudo da expressão de genes associados às características da qualidade de carne e eficiência alimentar. d) Desenvolvimento e implementação de algoritmos para simulação de informações moleculares e avaliação genética utilizando marcadores SNPs. e) Seleção genômica para características de carcaça e carne e eficiência alimentar em bovinos da raça Nelore. (AU)

Publicações científicas (13)
(Referências obtidas automaticamente do Web of Science e do SciELO, por meio da informação sobre o financiamento pela FAPESP e o número do processo correspondente, incluída na publicação pelos autores)
MAGALHAES, ANA F. B.; DE CAMARGO, GREGORIO M. F.; FERNANDES JUNIOR, GERARDO A.; GORDO, DANIEL G. M.; TONUSSI, RAFAEL L.; COSTA, RAPHAEL B.; ESPIGOLAN, RAFAEL; SILVA, RAFAEL M. DE O.; BRESOLIN, TIAGO; DE ANDRADE, WILLIAN B. F.; TAKADA, LUCIANA; FEITOSA, FABIELI L. B.; BALDI, FERNANDO; CARVALHEIRO, ROBERTO; CHARDULO, LUIS A. L.; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. Genome-Wide Association Study of Meat Quality Traits in Nellore Cattle. PLoS One, v. 11, n. 6 JUN 30 2016. Citações Web of Science: 0.
MELO, THAISE P.; TAKADA, LUCIANA; BALDI, FERNANDO; OLIVEIRA, HENRIQUE N.; DIAS, MARINA M.; NEVES, HAROLDO H. R.; SCHENKEL, FLAVIO S.; ALBUQUERQUE, LUCIA G.; CARVALHEIRO, ROBERTO. Assessing the value of phenotypic information from non-genotyped animals for QTL mapping of complex traits in real and simulated populations. BMC GENETICS, v. 17, JUN 21 2016. Citações Web of Science: 0.
VALENTE, TIAGO SILVA; BALDI, FERNANDO; SANT'ANNA, ALINE CRISTINA; ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; RODRIGUES PARANHOS DA COSTA, MATEUS JOSE. Genome-Wide Association Study between Single Nucleotide Polymorphisms and Flight Speed in Nellore Cattle. PLoS One, v. 11, n. 6 JUN 14 2016. Citações Web of Science: 0.
GORDO, D. G. M.; ESPIGOLAN, R.; TONUSSI, R. L.; JUNIOR, G. A. F.; BRESOLIN, T.; BRAGA MAGALHAES, A. F.; FEITOSA, F. L.; BALDI, F.; CARVALHEIRO, R.; TONHATI, H.; DE OLIVEIRA, H. N.; CHARDULO, L. A. L.; DE ALBUQUERQUE, L. G. Genetic parameter estimates for carcass traits and visual scores including or not genomic information. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 94, n. 5, p. 1821-1826, MAY 2016. Citações Web of Science: 0.
LEMOS, MARCOS V. A.; JUSTINO CHIAIA, HERMENEGILDO LUCAS; BERTON, MARIANA PIATTO; FEITOSA, FABIELI L. B.; ABOUJAOUD, CAROLYN; CAMARGO, GREGORIO M. F.; PEREIRA, ANGELICA S. C.; ALBUQUERQUE, LUCIA G.; FERRINHO, ADRIELLE M.; MUELLER, LENISE F.; MAZALLI, MONICA R.; FURLAN, JOYCE J. M.; CARVALHEIRO, ROBERTO; GORDO, DANIEL M.; TONUSSI, RAFAEL; ESPIGOLAN, RAFAEL; DE OLIVEIRA SILVA, RAFAEL MEDEIROS; DE OLIVEIRA, HENRIQUE NUNES; DUCKETT, SUSAN; AGUILAR, IGNACIO; BALDI, FERNANDO. Genome-wide association between single nucleotide polymorphisms with beef fatty acid profile in Nellore cattle using the single step procedure. BMC Genomics, v. 17, MAR 9 2016. Citações Web of Science: 0.
FERNANDES JUNIOR, GERARDO A.; ROSA, GUILHERME J. M.; VALENTE, BRUNO D.; CARVALHEIRO, ROBERTO; BALDI, FERNANDO; GARCIA, DIOGO A.; GORDO, DANIEL G. M.; ESPIGOLAN, RAFAEL; TAKADA, LUCIANA; TONUSSI, RAFAEL L.; DE ANDRADE, WILLIAN B. F.; MAGALHAES, ANA F. B.; CHARDULO, LUIS A. L.; TONHATI, HUMBERTO; DE ALBUQUERQUE, LUCIA G. Genomic prediction of breeding values for carcass traits in Nellore cattle. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 48, JAN 29 2016. Citações Web of Science: 0.
COSTA, RAPHAEL B.; CAMARGO, GREGORIO M. F.; DIAZ, IARA D. P. S.; IRANO, NATALIA; DIAS, MARINA M.; CARVALHEIRO, ROBERTO; BOLIGON, ARIONE A.; BALDI, FERNANDO; OLIVEIRA, HENRIQUE N.; TONHATI, HUMBERTO; ALBUQUERQUE, LUCIA G. Genome-wide association study of reproductive traits in Nellore heifers using Bayesian inference. GENETICS SELECTION EVOLUTION, v. 47, AUG 19 2015. Citações Web of Science: 2.
CHIAIA, H. L. J.; DE LEMOS, M. V. A.; VENTURINI, G. C.; ABOUJAOUDE, C.; BERTON, M. P.; FEITOSA, F. B.; CARVALHEIRO, R.; ALBUQUERQUE, L. G.; DE OLIVEIRA, H. N.; BALDI, F. Genotype x environment interaction for age at first calving, scrotal circumference, and yearling weight in Nellore cattle using reaction norms in multitrait random regression models. JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE, v. 93, n. 4, p. 1503-1510, APR 2015. Citações Web of Science: 1.
BALDASSINI, WELDER ANGELO; BRAGA, CAMILA PEREIRA; LOYOLA CHARDULO, LUIS ARTUR; II VASCONCELOS SILVA, JOSINEUDSON AUGUSTO; MALHEIROS, JESSICA MORAES; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO; FERNANDES, TALITA TANAKA; PADILHA, PEDRO DE MAGALHAES. Bioanalytical methods for the metalloproteomics study of bovine longissimus thoracis muscle tissue with different grades of meat tenderness in the Nellore breed (Bos indicus). Food Chemistry, v. 169, p. 65-72, FEB 15 2015. Citações Web of Science: 1.
SIMIELLI FONSECA, LARISSA FERNANDA; JOVINO GIMENEZ, DANIELE FERNANDA; ZERLOTTI MERCADANTE, MARIA EUGENIA; MARTINS BONILHA, SARAH FIGUEIREDO; FERRO, JESUS APARECIDO; BALDI, FERNANDO; PABLOS DE SOUZA, FABIO RICARDO; DE ALBUQUERQUE, LUCIA GALVAO. Expression of genes related to mitochondrial function in Nellore cattle divergently ranked on residual feed intake. MOLECULAR BIOLOGY REPORTS, v. 42, n. 2, p. 559-565, FEB 2015. Citações Web of Science: 1.
DIAS, M. M.; SOUZA, F. R. P.; TAKADA, L.; FEITOSA, F. L. B.; COSTA, R. B.; DIAZ, I. D. P. S.; CARDOSO, D. F.; TONUSSI, R. L.; BALDI, F.; ALBUQUERQUE, L. G.; OLIVEIRA, H. N. Study of lipid metabolism-related genes as candidate genes of sexual precocity in Nellore cattle. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 1, p. 234-243, 2015. Citações Web of Science: 1.
ESPIGOLAN, R.; BALDI, F.; BOLIGON, A. A.; SOUZA, F. R. P.; FERNANDES JUNIOR, G. A.; GORDO, D. G. M.; VENTURINI, G. C.; DE CAMARGO, G. M. F.; FEITOSA, F. L. B.; GARCIA, D. A.; TONHATI, H.; CHARDULO, L. A. L.; OLIVEIRA, H. N.; ALBUQUERQUE, L. G. Associations between single nucleotide polymorphisms and carcass traits in Nellore cattle using high-density panels. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 3, p. 11133-11144, 2015. Citações Web of Science: 0.
TONUSSI, R. L.; ESPIGOLAN, R.; GORDO, D. G. M.; MAGALHAES, A. F. B.; VENTURINI, G. C.; BALDI, F.; DE OLIVEIRA, H. N.; CHARDULO, L. A. L.; TONHATI, H.; DE ALBUQUERQUE, L. G. Genetic association of growth traits with carcass and meat traits in Nellore cattle. Genetics and Molecular Research, v. 14, n. 4, p. 18713-18719, 2015. Citações Web of Science: 1.
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