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Laboratório associado de bioinformática no Programa Humano do Câncer

Processo: 00/08723-1
Linha de fomento:Auxílio à Pesquisa - Programa GENOMA
Vigência: 01 de agosto de 2000 - 30 de setembro de 2002
Área do conhecimento:Ciências Biológicas - Biologia Geral
Convênio/Acordo: Instituto Ludwig
Pesquisador responsável:Arthur Gruber
Beneficiário:Arthur Gruber
Instituição-sede: Faculdade de Medicina Veterinária e Zootecnia (FMVZ). Universidade de São Paulo (USP). São Paulo, SP, Brasil
Assunto(s):Biologia computacional  Laboratórios  Genoma Humano do Câncer 

Resumo

O Projeto Humano do Câncer é uma iniciativa conjunta da FAPESP e do Instituto Ludwig de Pesquisa sobre o Câncer para a descoberta de genes humanos e compilação de regiões codificadoras humanas baseado em um novo conceito para o sequenciamento em larga escala de fases abertas de leitura (ORFs). O projeto consiste inteiramente no sequenciamento e análise de fragmentos curtos de cDNA gerados preferencialmente a partir de porções centrais de genes expressos humanos. Os fragmentos, denominados ORESTES, são gerados utilizando-se uma estratégia desenvolvida e patenteada pelo Instituto Ludwig. O projeto pretende montar os dados obtidos em conjunto com os dados existentes no Genbank e Unigene, resultando em ORFs anotadas potencialmente completas. Para a fase de análise dos dados foi montada uma rede de 10 laboratórios de Bioinformática associados ao laboratório de Bioinformática do Instituto Ludwig de Pesquisa contra o Câncer. O maior objetivo dessa rede é o de explorar detalhadamente essas sequências obtidas no Genoma Câncer. Além disso, pretende-se prover uma oportunidade de treinamento em biologia computacional para estudantes de graduação e pós-graduação. (AU)

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